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CSB遗传变异与肿瘤发病风险及肺癌预后关系研究

吴敬

CSB遗传变异与肿瘤发病风险及肺癌预后关系研究

吴敬1
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作者信息

  • 1. 华北理工大学
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摘要

目的: CSB(Cockayne syndrome type B)是转录偶联核苷酸切除修复通路的重要组分,在肿瘤发生发展过程中发挥重要作用。本研究的目的之一在于用Meta分析方法研究CSB单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNPs)与多种肿瘤发病风险之间的关系;目的之二在于分析CSB遗传变异对经铂类化疗后非小细胞肺癌患者预后的影响。 方法:第一章:我们采用计算机配合手工检索的方式,使用PubMed、Embase、中国知网等数据库,检索2015年12月之前证实发表的CSB单核苷酸多态与肿瘤发病关系的文献。使用 R3.1.3软件进行 Meta分析,计算 OR(Odds ratios)及其95%CI(confidence interval),并绘制森林图,用Q统计量来评价纳入的各研究之间的异质性。第二章:将238例于2008年3月至2012年12月期间在华北理工大学附属唐山市工人医院确诊为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的患者作为研究对象。使用人类单体型数据库提供的基因分型数据,用软件Haploview4.2获得位于CSB基因的标签 SNP(tagSNPs)。采用 iPlex Gold Genotyping Assay和Sequenom MassArray基因分型技术对所有目标tagSNPs进行基因分型。用Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,Log-rank法检验评价经CSB标签遗传变异对NSCLC预后的影响。Cox多因素回归模型进一步分析经铂类药物化疗后NSCLC患者预后的影响因素。 结果:第一章:经检索最终有26项研究纳入本次Meta分析,共包括4个CSB遗传变异(rs2228526,rs2228527,rs2228529,rs4253211)。其中,rs2228526多态研究包括3206名肿瘤患者和3694名正常对照对照;rs2228527多态研究包括4634名肿瘤患者和6063名正常对照;rs2228529多态研究包括2467名肿瘤患者和2634名正常对照;rs4253211多态研究包括4870名肿瘤患者和6561名正常对照。我们的Meta分析没有发现任何CSB遗传变异影响肿瘤发病风险。第二章:CSB遗传变异对肺癌患者生存的影响。使用 Haploview软件筛选了位于 CSB基因的9个 tagSNPs(rs2228526, rs2228528, rs2281793, rs3750751, rs4253101, rs2274097, rs2377902, rs4240506, rs4253212)。生存分析发现男性患者的中位生存时间(median survival time,MST)为24个月,明显低于女性患者(MST=32月)(Log-rank P=0.012)。CSB rs2228526 AA基因型携带者的MST为29个月,明显高于AG基因型携带者(MST为21个月),两者之间具有统计学差异(Log-rank P=0.002);rs2281793 CC基因型携带者的MST为25个月,TT基因型携带者的MST为55个月,两者比较具有统计学差异(Log-rank P=0.004);rs4253101AA基因型携带者的MST(29个月)低于AC基因型携带者(M21个月),两者比较有统计学差异(Log-rank P=0.002);rs4240506位点AA基因型携带者的MST为33个月,明显高于AG(24个月)和GG基因型携带者(27个月)(Log-rank P=0.026,0.042)。Cox多因素回归分析显示,rs2228526 AG基因型和rs4253101 AC基因型均是影响非小细胞肺癌预后的独立影响因素(HR=1.86,95%CI=1.16-2.99,P=0.011)。 结论: CSB rs2228526和rs4253101遗传变异可影响NSCLC患者接受铂类化疗生存时间,可能为NSCLC患者铂类化疗后个体化用药的选择提供理论依据。

关键词

单核苷酸/Meta分析/非小细胞肺癌/发病风险/遗传变异/铂类化疗/生存时间

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授予学位

硕士

学科专业

医学生物信息学

导师

张雪梅

学位年度

2016

学位授予单位

华北理工大学

语种

中文

中图分类号

R73
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