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谷子酶解物抗氧化性的研究及超氧化物歧化酶的生物信息学分析

赵艳

谷子酶解物抗氧化性的研究及超氧化物歧化酶的生物信息学分析

赵艳1
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作者信息

  • 1. 河北北方学院
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摘要

谷子是我国传统的粮食作物之一,主要种植在北方。谷子的基因组小、生育期短、且为二倍体,与玉米、水稻、高粱等作物具有很高的共线性,使其成为禾本科基因组研究的模式植物之一,也成为研究C4植物的模式植物。本研究以谷子为研究对象,分两部分进行,第一部分是对谷子蛋白的提取及对蛋白酶解液的抗氧化作用研究,第二部分是谷子抗氧化物歧化酶的生物信息学分析。 谷子蛋白的提取试验通过对提取时间、提取剂与底物的固液比、提取剂浓度三个方面探究蛋白的提取条件。结果显示谷子蛋白提取的最佳时间为3h,提取醇蛋白的最佳固液比例是1∶14,提取谷蛋白的最佳比例是1∶16,提取球蛋白的最佳浓度为4%的NaCl溶液,提取醇蛋白的最佳浓度为70%乙醇溶液,提取谷蛋白的最佳浓度为0.45%的NaOH溶液。在进行酶解试验时,首先使用计算机模拟水解,再使用胰蛋白酶、胃蛋白酶单独水解,嗜热菌蛋白酶与胰蛋白酶、胃蛋白酶分别联合水解。结果表明:单独使用胰蛋白酶可得到65种多肽,共72条;单独使用胃蛋白酶可酶解得到122种多肽,共264条;嗜热菌蛋白酶-胃蛋白酶联用可得到2198种多肽,共6344条;嗜热菌蛋白酶-胰蛋白酶联用可得到2239种多肽,共7436条。模拟水解的结果还表明单独用酶方法,胃蛋白酶效果好于胰蛋白酶,联合使用嗜热菌蛋白酶后,胰蛋白酶的酶解效果要好于胃蛋白酶。自由基清除试验结果进一步证实了这一结果,并且也证实了联合水解所得酶解液对DPPH自由基清除能力远高于单步水解所得酶解液清除DPPH自由基的能力。 第二部分以谷子基因数据库为平台,利用生物信息学方法对谷子超氧化物歧化酶(SOD)基因家族进行全基因组扫描和分析。结果表明,谷子SOD基因家族包括8个基因,分布在6条染色体上,氨基酸序列长度在56~334aa之间,外显子数量为1~9,分析该家族具有3个SOD结构域,5个保守序列,进化树分析表明,谷子与粳稻、高粱SOD蛋白序列具有一定同源性。研究结果为进一步研究谷子抗氧化机制提供一定理论依据。

关键词

谷子蛋白/提取工艺/酶解液/活性肽/超氧化物歧化酶/生物信息学/抗氧化机制

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授予学位

硕士

学科专业

药物化学

导师

刘颖慧

学位年度

2017

学位授予单位

河北北方学院

语种

中文

中图分类号

R2
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