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儿童特发性全身性癫痫易感基因CACNA1H及GABRB3的分析研究

刘敏

儿童特发性全身性癫痫易感基因CACNA1H及GABRB3的分析研究

刘敏1
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作者信息

  • 1. 广西医科大学
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摘要

目的:探讨T型钙通道CACNA1H基因变异与中国广西汉族儿童特发性全身性癫痫(IGE)的关系。 方法:对100例中国广西汉族IGE患儿和100例汉族健康对照者应用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)方法扩增CACNA1H基因外显子9~11编码区及两侧各50个碱基以上的序列,PCR产物经ABI-PRISM3730全自动DNA测序仪自动测序,然后与NCBI数据库中CACNA1H基因的序列进行比对,了解CACNA1H基因突变情况,利用生物信息学方法预测CACNA1H基因突变对蛋白质功能的影响。 结果: 1.在IGE患儿中,发现CACNA1H基因两个新的杂合子突变,1254211G>A及1254303A>T,均位于第10外显子上。分别导致所编码的氨基酸发生改变,Arg735Gln及Arg766Trp。 2.CACNA1H基因编码第735位及第766位Arg在生物进化过程中处于部分保守区域。 3.用SIFT和PolyPhen程序预测CACNA1H基因点突变,显示Arg766Trp有可能影响蛋白质的功能。 4.共发现CACNA1H基因的14个多态性位点,其中有5个变异在NCBI的SNP数据库中未见收录,在IGE组及对照组中比较了7个SNPs位点的基因型、等位基因及单体型的频率分布,结果显示无显著性差异。 结论:T型钙通道CACNA1H基因突变可能与中国广西IGE患儿的发生有关,CACNA1H基因很可能是IGE的易感基因。

关键词

儿童特发性全身性癫痫/基因突变/单核苷酸多态性/蛋白质功能

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授予学位

博士

学科专业

儿科学

导师

庞玉生

学位年度

2012

学位授予单位

广西医科大学

语种

中文

中图分类号

R74
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