摘要
目的： 寻找患有先天性耳聋及视网膜变性同胞姐弟的致病基因位点。 方法： 应用全外显子捕获测序技术，对人类基因组上1%的基因编码区进行捕获，体外进行扩增，并在hiseq2500高通量测序仪上进行并行测序，运用生物信息学方法分析测序数据与测序质量，并计算外显子区的覆盖度与测序深度，使用主流的数据分析流程GATK检测变异位点，并使用Annovar对位点进行注释，采用最新的致病位点算法 pVAAST分析排序致病位点，分析致病位点在数据库中的频率、危害性及保守性，一代测序验证位点在家系中是否共分离。 结果： 1.一家四口全外显子测序数据都在10G以上，80%的碱基测序质量在Q30以上； 2.对外显子区域测序深度分析，平均测序深度在110X以上，99%区域大于10X； 3. pVAAST分析显示MYO7A基因的两个位点为最可能致病基因； 4. MYO7A两位点在公共数据库中均未见报导，其中一个位点 c.5994G>A为无义突变，使蛋白翻译提前终止，另一位点c.849+2T>C在剪切位点附近，该位点经scSNV算法评估影响外显子剪切； 5.通过PhastCons算法评估两个位点均非常保守，一代Sanger测序验证，父母各携带一个位点杂合子，姐弟为复合杂合突变，符合隐性遗传传递模式。 结论： 应用全外显子测序技术寻找到一个Usher综合征核心家系的两个MYO7A致病位点，为临床进行核心家系的遗传致病位点鉴定提供了有义的探索。
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