河西走廊盐碱土壤中未培养放线菌多样性研究

扫码查看

原文链接

NETL

中文摘要：为更加准确了解河西走廊地区盐碱土壤中放线菌种群结构及其多样性信息。提取盐碱土样微生物总DNA，用放线菌特异性引物扩增16S rRNA基因片段，构建土壤放线菌16S rRNA基因克隆文库，用HaeⅢ和HhaⅠ两种限制性内切酶进行酶切分析，对酶切带型不同的菌液进行测序，并进行多样性和系统发育分析。研究结果表明：通过4种方法对盐碱土微生物总DNA进行提取比较，CaCl2-SDS-酶解法是一种最适于河西走廊盐碱土壤微生物总DNA的提取方法。对河西走廊盐碱土中放线菌多样性指数进行分析，疏勒河流域土样中放线菌多样性为原生>次生>农田；黑河流域土样中放线菌多样性为次生>原生；石羊河流域土样中放线菌多样性为次生>原生>农田。通过对河西走廊地区土样中放线菌的16S rRNA基因序列进行系统发育分析，结果表明：疏勒河流域原生盐碱土(S1)中放线菌分属于微球菌亚目、丙酸杆菌亚目、棒状杆菌亚目、弗兰克氏菌亚目、假诺卡氏菌亚目共5个亚目和放线菌未知类群；次生盐碱土(S2)中放线菌分属于微球菌亚目和丙酸杆菌亚目共2个亚目和放线菌未知类群；农田土(S3)中放线菌分属于微球菌亚目和棒状杆菌亚目共2个亚目。黑河流域原生盐碱土(S4)中放线菌分属于微球菌亚目、丙酸杆菌亚目、棒状杆菌亚目、链霉菌亚目共4个亚目和未知放线菌类群；次生盐碱土壤(S5)中放线菌分属于微球菌亚目、丙酸杆菌亚目、链霉菌亚目、微单孢菌亚目、棒状杆菌亚目、假诺卡氏菌亚目共6个亚目和放线菌未知类群。石羊河流域原生盐碱土(S6)中放线菌分属于微球菌亚目、弗兰克氏菌亚目、丙酸杆菌亚目、链霉菌亚目、棒杆菌亚目共5个亚目和放线菌未知类群；次生盐碱土(S7)中放线菌分属于微球菌亚目、弗兰克氏菌亚目、丙酸杆菌亚目、微单孢菌亚目、假诺卡氏亚目、链霉菌亚目、链孢囊菌亚目共7个亚目和放线菌未知类群；在农田土(S8)中放线菌分属于微球菌亚目、弗兰克氏菌亚目、丙酸杆菌亚目共3个亚目和放线菌未知类群。按土样类型不同对放线菌的16S rRNA基因序列进行系统发育分析，原生盐碱土中放线菌分属于微球菌亚目、丙酸杆菌亚目、棒状杆菌亚目、弗兰克氏菌亚目、假诺卡氏菌亚目、链霉菌亚目、链孢囊菌亚目共7个亚目和放线菌未知类群；次生盐碱土中放线菌分属于微球菌亚目、丙酸杆菌亚目、棒状杆菌亚目、弗兰克氏菌亚目、假诺卡氏菌亚目、链霉菌亚目、链孢囊菌亚目、微单孢菌亚目共8个亚目和放线菌未知类群；农田土中放线菌分属于微球菌亚目、弗兰克氏菌亚目、棒状杆菌亚目、丙酸杆菌亚目共4个亚目和放线菌未知类群。

作者：

李海云

展开 >

关键词：

河西走廊盐碱土壤放线菌多样性基因克隆系统发育分析

授予学位：

硕士

学科专业：

微生物学

导师：

牛世全

学位年度：

2015

学位授予单位：

西北师范大学

语种：

中文

中图分类号：

Q93