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鮸鱼IRF9基因及其在免疫信号通路中的作用研究

赵雪延

鮸鱼IRF9基因及其在免疫信号通路中的作用研究

赵雪延1
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作者信息

  • 1. 浙江海洋大学
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摘要

在众多种类的转录因子中,干扰素调节因子是一类非常重要的成员。它被发现的最早的功能就是能够调节干扰素的表达。所有的干扰素调节因子家族成员都能够调节干扰素及干扰素相关基因的作用。另外,它在免疫应答、抗病毒、细胞生长调节以及细胞凋亡中发挥着必不可少的作用。迄今为止,其实已经有大量的干扰素调节因子的家族成员在哺乳动物中深入的研究,然而它在低等的脊椎动物中的研究相对很少。本文主要对鮸鱼IRF9基因进行了鉴定,并且分析了鮸鱼IRF9基因的分子特征、进化特征。另外还研究了IRF9基因的调控功能,最终的主要结论如下: (1)鮸鱼IRF9基因的全长序列从鮸鱼基因组中获得,其中它的ORF区长度为1305bp,编码434个氨基酸。其IRF9基因结构与其他物种的IRF9基因结构进行对比分析发现鮸鱼IRF9与其他低等脊椎动物的IRF9是一致的,都有着相似的结构并且有着非常保守的结构域。 (2)在鱼类中,鮸鱼的IRF9基因具有非常保守的线性,在其上游和下游的基因分别是rnf31和emc9。在两栖类和哺乳动物中比较分析,IRF9基因也具有非常保守的线性,在其上游和下游的基因分别是rnf31和rec8。 (3)IRF9基因属于IRF4亚家族,IRF4亚家族基因包括IRF4,IRF8,IRF9以及IRF10基因。根据IRF4亚家族的进化树结果分析,IRF4是一个独立的分支,但其与IRF10有着相对较强的同源性。此外,所有四足类的IRF9基因聚在一起,所有鱼类的IRF9基因也聚在一个分支上。在进化过程中,除了鸟类以外,IRF9基因在其余脊椎动物中都已经发现并研究。 (4)实时荧光定量实验结果分析,鮸鱼IRF9能够广泛表达于多种组织中。在正常组织、感染组织和巨噬细胞的表达中看出,鮸鱼的IRF9基因在所有组织中均表达并且在刺激poly(I:C)之后,在肝,肾和巨噬细胞中检测到IRF9的表达均是上升的。 (5)免疫荧光实验结果分析发现,在未受到刺激的Hela细胞中,IRF9基因主要分布在细胞的细胞质部分。 (6)双荧光素酶报告基因实验表明鮸鱼IRF9能够诱导激活IFNα和IFNβ报告基因活性。 (7)鮸鱼IRF9基因能够抑制TRIF介导的NF-κB信号通路,IRF9-shRNA通过敲降IRF9基因的表达从而能够缓解这种抑制作用。另外,我们发现起到抑制作用的结构域主要是IRF9基因的DBD结构域。

关键词

鮸鱼/IRF9基因/免疫信号通路/细胞检测

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授予学位

硕士

学科专业

海洋科学

导师

徐田军

学位年度

2018

学位授予单位

浙江海洋大学

语种

中文

中图分类号

S9
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