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小麦TaTGA1和TaNAC29转录因子克隆及其抗逆功能分析

徐仲阳

小麦TaTGA1和TaNAC29转录因子克隆及其抗逆功能分析

徐仲阳1
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作者信息

  • 1. 西北农林科技大学
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摘要

bZIP和NAC是植物转录因子中两个重要的家族,参与植物的生长发育和逆境胁迫,在水稻、拟南芥等模式植物中研究比较多,但在小麦中研究甚少。我们对普通小麦中的bZIP和NAC转录因子进行了部分研究,期望找到一些相关的转录因子,以期为小麦抗逆分子设计辅助育种提供目标基因。 本研究对小麦转录组数据库和小麦基因组芯片数据进行分析,筛选出bZIP类TGA和NAC的EST探针序列,以筛选的探针为参考序列进行电子克隆,以普通小麦为材料进行生物和非生物胁迫处理,得到不同时期的RNA,以其cDNA为模板进行RACE克隆,用RT-PCR对其表达特征和表达模式进行研究,结合生物信息学进行进一步分析以揭示其作用机制,主要得到如下结果: 1. 在芯片中筛选出了66个小麦基因组的bZIP类TGA的EST探针序列和41个NAC的EST探针序列,在TGA中发现的Ta.5410.2.S1_a_at和Ta.1612.1.S1_at两个探针参与小麦对白粉菌的胁迫;在NAC中发现的TaAffx.122104.1.S1_s_at探针参与小麦对盐胁迫。分别在N9134和郑麦9023中进行克隆。得到了与白粉抗性相关的TaTGA1s和盐胁迫相关的TaNAC29转录因子。 2.对N9134用白粉(Blumeria graminisf. sp. tritici; Bgt)E09生理小种进行侵染,发现 TaTGA1s 转录因子表达特异,经过序列比对与小麦种内 TGA 因子同源,命名为TaTGA1。TaTGA1包含2个直系同源基因,分别命名为TaTGA1a和TaTGA1b。TaTGA1a由2547个核酸构成,TaTGA1b由1818个核酸组成,它们共同编码含有312个氨基酸的多肽。 3. TaTGA1序列特征分析表明,TaTGA1a基因组DNA包含8个内含子和9个外显子,TaTGA1b包含9个内含子和10个外显子;染色体定位和生物信息学分析结果表明, TaTGA1a和TaTGA1b 分别由 4AS-5969591和4BL-7004698 转录而来;转录分析表明TaTGA1a和TaTGA1b均参与植物防御白粉菌侵染。氨基酸序列进行比对,发现TaTGA1和来源于粗山羊草(Aegilops tauschii)的XP020199874.1(bZIP家族TGA类型)具有较高同源性,是在小麦N9134中新发现的一个转录因子。TaTGA1多肽估算的理论分子量为34.84kD,等电点为8.94,其碱性亮氨酸拉链结构域位于24-87aa,其与TGA转录因子类似的结构域位于110-185aa。 4. 利用 Affymetrix 小麦基因芯片信息分析找到了一个与盐胁迫有关的序列E-MEXP-971,对应的探针序列TaAffx.122104.1.S1_s_at在小麦盐胁迫下表现上调。以此探针为种子序列,以郑麦9023的cDNA为模板克隆了该序列。序列分析发现,其编码298个氨基酸,与粗山羊草(Aegilops tauschii)NAC29转录因子(AetNAC29)高度同源,序列一致性达到了86%,因此将其命名为TaNAC29(KP657687)。经过多序列比对,发现TaNAC29与乌拉尔图小麦(Triticum urartu)NAC29转录因子(TuNAC29)、普通小麦NAC69转录因子(TaNAC69)在氨基酸水平上也高度同源,序列一致性分别达到了81%、85%。 5. 利用RT-PCR对TaNAC29转录因子的表达谱进行检测,在NaCl、PEG和ABA胁迫下,TaNAC29基因的转录水平均呈上调表达。NaCl胁迫下,TaNAC29的转录水平在12h时达到峰值,然后逐渐回落;ABA处理也显示出了同样的趋势,在12h时 TaNAC29表达量达到峰值,然后逐渐回落;PEG 处理中,TaNAC29 也表现为上调,在 24h 时达到峰值,然后逐渐回落。揭示了TaNAC29转录因子被NaCl、PEG和ABA诱导表达。 6. TaNAC29转录激活研究表明,含有BD-TaNAC29融合体的AH109酵母菌株在缺陷SD培养基(SD/-Trp-His或SD/-Trp-Ade)能正常生长,证明TaNAC29能激活AH109酵母菌株中的HIS3和ADE2报告基因,揭示了TaNAC29具有转录激活能力。对TaNAC29转基因拟南芥过表达生理研究发现,在盐胁迫下,TaNAC29过表达的两个转基因纯系通过提高SOD、POD、APX和CAT酶的活性来减少体内ROS的积累,减轻细胞膜的损伤程度。

关键词

小麦/bZIP转录因子/NAC转录因子/基因克隆/抗逆功能

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授予学位

博士

学科专业

作物遗传育种

导师

吉万全

学位年度

2018

学位授予单位

西北农林科技大学

语种

中文

中图分类号

S5
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