摘要
乌桕(Sapium sebiferum (L.) Roxb.ndl)作为中国特有落叶乔木，树形优美，是极具观赏价值的彩叶树种之一,其体内所含的大量植物油，被广泛应用到工业、食品、日用护肤品等领域。由于乌桕栽培历史悠久、引种选育过程繁琐，亲子代间世代交替背景复杂，导致当前乌桕种质资源遗传谱系尚不明了。近年来，关于乌桕遗传多样性的研究较少，且参所选种质代表性不足，所用分子技术有限。因此，本研究利用Illumina HiSeq2500测序平台对乌桕嫩叶进行转录组测序，挖掘SSR位点，并利用多态性SSR位点对13个地源的乌桕种质进行遗传评价。主要结论如下: 1. 对乌桕嫩叶进行转录组测序，共获得8.0G的数据量，利用Trinity拼接后获得Unigene 59441条，平均长度692bp，波动范围是300~6929bp；通过与Nr蛋白数据库进行比对，42020条Unigege成功获得到注释，注释比例为70.69%；随后将注释的Unigene用GO信息库作参考，有31277条Unigene被注释，其功能分为49类，包括了分细胞组分、 基因的分子功能和参与的生物过程三个部分。 2. 使用软件MISA对测序获得的59441条Unigene进行SSR位点搜索，共检测到SSR位点7344个，频率为12.36%。随机挑选120对SSR位点使用软件Primer 3对上述SSR位点进行引物设计，选择地源相隔较远的6份乌桕种质对其进行筛选，共有98对引物能扩增出明亮、清晰的条带，扩增效率为81.67%。其中，有10对引物具有多态性，占比8.33%。 3. 利用得到的10对多态性EST-SSR引物对236份乌桕种质进行遗传评价，结果显示所采集乌桕种质遗传多样性高，有效等位基因数Ne(1.9884)、香农指数I(0.7045)等系数与鹅掌楸等观叶林木相近。利用UPGMA法，对13个地源的乌桕进行聚类，地源相近群体无法聚到一起。利用NJ法对236份乌桕种质也单独进行聚类，同地源的个体也无法全部聚到一起，说明遗传关系与乌桕地理分布没有明显关联。 本研究首次开发了乌桕转录组SSR分子标记，并利用筛选得到的多态性引物对236份乌桕种质进行了遗传评价，为乌桕种质资源的研究、保护及利用奠定了理论基础。
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