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新疆三个隔离人群Y染色体和线粒体遗传多样性分析

刘树虎

新疆三个隔离人群Y染色体和线粒体遗传多样性分析

刘树虎1
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  • 1. 新疆大学
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摘要

新疆地处亚欧大陆腹地,自古以来是联系东西方文明的纽带。新疆地区人群的遗传多样性是长期以来东西方人群交流融合的结果,也是中华民族总体遗传构成中不可或缺的重要组成部分,是我国独特的遗传资源。而世居新疆的人群、尤其是至今仍然很少与外界交流、处于相对隔离生活状态的人群,是研究人群基因交流、环境适应以及地域性高发疾病的宝贵遗传资源。对新疆罗布人、克里雅人、刀郎人进行系统的遗传多样性研究,利用基因组数据研究人群的迁移和融合,开展以新疆隔离人群为模型的环境适应和疾病基因定位研究具有重要意义。 Y染色体严格遵循父系遗传,而Y-NRY在减数分裂过程中不与X染色体配对,这使其只通过碱基突变来积累变异信息。通过测定Y-NRY的突变标记,可追踪父系遗传的进程。Y-SNP具有很强的地域特异性,测定不同地域人群的Y染色体单倍群类型,可推断人群进化、迁徙及相关历史活动,能有效地评估群体的遗传结构。通过对三个隔离人群Y染色体遗传多样性分析结果表明:克里雅人群检出 12 种单倍群,高频单倍群有 J2a1b1(25.64%), R1a1a1b2a(20.51%), R2a(17.95%), R1a1a1b2a2(15.38%); 罗布人群检出16种单倍群,高频单倍群有J2a1(43.75%), J2a2(14.06%), R2(9.38%), L1c(7.81%); 刀郎人群检出40种单倍群,高频单倍群有 R1b1a1a1(9.21%), R1a1a1b2a1a(7.89%), R1a1a1b2a2b(6.58%), C3c1(6.58%),三个隔离人群与维吾尔族亲缘关系较近;在单倍群类型和频率上与维吾尔族最接近且无显著性差异(f=0.833,p=0.367)。此外,三个隔离人群单倍群类型和频率显示明显的亚欧混合现象,经过长期基因融合使其具有中亚人群的典型特征,适用于法医遗传学。 人类线粒体DNA是核外唯一遗传物质,呈闭合环状全长16569bp, 由控制区和编码区构成,控制区碱基多态性使人群间存在高度特异性,这种碱基多态性可为人群的进化提供参考资料。mtDNA具有高突变率、母系遗传、无重组、单拷贝、不受选择压力影响等特征,使其成为人类学研究中重要的分子载体。通过对三个隔离人群mtDNA遗传多样性分析结果表明:克里雅人、罗布人、刀郎人mtDNA变异位点分别检出256, 315, 735处,其中多态性位点分别检出245, 298, 639处,A263G, A750G, A8860G, A15326G 4处位点在三人群中变异率均为100%;克里雅人检测出20种单倍型,高频单倍型有F1a1(15.71%), M8a2a1(12.86%), H1t(11.43%), M11a2(10.00%), 罗布人检测出 27 种单倍型,高频单倍型有B5b2c(31.71%), H6a1b2(18.90%), D4c2a(13.41%), 刀郎人检测出100种单倍型,主要集中在D, H, U, C主单倍型,各单倍型频率都不高,最高的为H2a1a(4.47%);三人群单倍型多样性分别为0.9264, 0.8360, 0.9910, 平均核苷酸配对差异数目为30.2714, 36.1220, 32.5506, 个体识别率为0.9132, 0.8309, 0.9854. 三个人群单倍群类型和频率与维吾尔族最接近,亲缘关系最密切。此外,三个人群mtDNA遗传结构显示明显的亚欧混合现象,这与丝绸之路贸易的兴起-昌盛-衰落密不可分,是人群长期基因融合的结果。 原发性高血压(essential hypertension, EH): 是一种由某些先天性遗传基因与许多致病性增压因素和环境因素综合引起的多因素疾病,特点是不能发现导致血压升高的确切病因。本课题组在问卷调查和体质指标的测量时发现罗布人高血压患病率异常高,通过对罗布人基本临床指标和EH患者全线粒体基因组关联分析结果表明,罗布人EH患病率高达37.20%, 年龄、BMI、腰围与EH有显著的关联性;线粒体全基因组分析在EH组共发现变异位点235处,未报道过的10处,对照组共发现变异位点253处,未报道过的13处;70个位点变异只在EH组中被发现,这些位点可能与原发性高血压的发生有直接关联,87个位点变异只在对照组中被发现,这些位点可能对原发性高血压的发生有抑制作用。获得的tRNA变异位点tRNAArg T10410C, tRNALeu A12308G, tRNAThr A15951G可能与EH相关;线粒体蛋白质基因变异位点ND1(G3316A, G3438A, T4248C), ND2(A4824G, C4919T, T4937C), COⅠ(T5964C,C6104T, G6734A, G6852A, A6881G), COⅡ(T7954C, G8020A) , ATPase8(T8473C), ATPase6(A8633G, C8794T), COⅢ(G9477A, C9536T, A9632T, A9667G), ND3(C10181T), ND4(C11215T, A11467G), ND5(C12346T, G12372A, T13617C, C13720T, A13857G, T14287C, G14305A, T14319C, T14470C), Cytb(A14793G, C14815T, A14927G, T14979C, T15440C, C15448A, G15596A, A15758G)对EH的深入研究有意义。

关键词

隔离人群/Y染色体/线粒体DNA/遗传多样性

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授予学位

硕士

学科专业

生物学

导师

多力坤·买买提玉素甫

学位年度

2018

学位授予单位

新疆大学

语种

中文

中图分类号

R3
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