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肝泡型包虫病患者肠道菌谱分析

王江瑜

肝泡型包虫病患者肠道菌谱分析

王江瑜1
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作者信息

  • 1. 青海大学
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摘要

目的: 对比分析肝泡型包虫病(Hepatic alveolar echinococcosis,HAE)患者与健康人群肠道菌群,明确 HAE 患者肠道菌群特点,为研究 HAE 发生发展机制提供研究基础。 方法: 选取2016年11月~2017年08月在青海大学附属医院确诊的藏族HAE患者为研究对象,严格按照纳入与排除标准选择藏族HAE患者粪便样本30例为试验组。另选同期在我院经筛查后确认健康的藏族者粪便样本20例为对照组。提取粪便DNA,然后对粪便DNA的16SrDNA 进行PCR扩增及高通量测序来获取所有样品的肠道菌群信息,运用生物学分析方法了解肝泡型包虫病肠道菌群特点。 结果: 1.对照组与HAE组研究对象均为藏族,两组在年龄与性别上均无显著性差异(均P>0.05)。所有样品最终共获得有效序列3384213条,每个样本平均序列数约为67684条,单样品测得序列数最多为78242条,最少为57 814条,序列平均长度为413bp,测序结果良好。共聚类到1092个分类操作单元(Operational Taxonomic Units, OTU),每个样品平均466个OUT。两组中共有OUT数903个,HAE组特有OUT数152个,对照组特有OUT数37个,两组测序量及OUT数量无显著性差异(P>0.05)。 2.两组Alpha多样性分析结果显示:两组测序量足够,并且所测物种丰富且分布均匀,结果可以用于生物学分析;两组在Alpha多样性指数Shannon、Simpson、Chaol和ACE上均无显著性差异(均P>0.05),说明两组间肠道菌群的多样性及丰度无显著性差异;两组间主坐标分析及UPGMA聚类分析发现两组间样本虽然没有明显分开趋势,但是两组样本有一定聚类现象,说明两组样本菌群结构存在差异。 3.分类学分析发现两组间肠道菌群结构存在显著性差异,主要表现为在门水平上HAE组厚壁菌门(Firmicutes)丰度较对照组显著减少(60.447%vs. 69.508%,P=0.044),而其他菌门之间无显著性差异(P>0.05);在属水平上,HAE组厚壁菌门显著减少,主要是由于毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)中直肠真杆菌属(E . rectale)、挑剔真杆菌属(Eubacterium-eligens)和毛螺旋菌属(Lachnospira)显著减少引起的,另外厚壁菌门中瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)中的瘤胃球菌属(Ruminococcus)也显著减少。尽管HAE组厚壁菌门较对照组显著减少,但隶属于厚壁菌门中的肠球菌属( Enterococcus )却显著高于对照组(2.690% vs. 0.204%,P=0.001)。本研究还发现HAE组拟杆菌门中普氏菌属(prevolla)、变形菌门中克雷伯杆菌属(Klebsiella)和摩根氏菌属(Morganella)水平均显著高于对照组(均P<0.05)。 结论: 与对照组相比,HAE 组肠道菌群多样性无明显差异,但肠道菌群结构发生改变。本研究仅对HAE肠道菌群组成及结构进行了初步分析,今后还需加大样本进一步探讨。

关键词

肝泡型包虫病/肠道菌群/高通量测序/厚壁菌门

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授予学位

硕士

学科专业

外科学(普通外科)

导师

樊海宁

学位年度

2018

学位授予单位

青海大学

语种

中文

中图分类号

R3
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