摘要
鲍是中国重要的水产养殖贝类,具有较高的营养价值及巨大的经济价值,但鲍养殖群体性状衰退等问题日益凸显,种质资源保护与遗传改良的研究亟待加强。本研究利用形态标记及DNA分子标记的方法对多个养殖鲍种及其遗传改良品系进行形态学及遗传多样性研究,主要研究内容如下: 1、利用标点法、椭圆傅里叶分析法、线性测量法三种形态学方法定量研究了皱纹盘鲍、杂色鲍、绿鲍、红鲍、西氏鲍五种常见鲍养殖种的形态差异,并证实了用这三种方法研究形态差异的可行性。 2、利用线性测量法研究了皱纹盘鲍6个养殖群体的形态差异,比较了不同养殖群体肥满度、出肉率等指标的差异。聚类分析结果显示六个养殖群体之间形态差异较小,仅依靠形态差异很难区分开所有的养殖群体。利用21个微卫星标记研究了这6个养殖群体的遗传多样性,结果显示7个养殖群体的遗传多样性都比较高;多数位点符合哈迪温伯格平衡,但是青岛、大连群体中有较多的位点极度偏离平衡;群体两两之间的Fst值显示洋下群体与其他6个群体之间出现了中等分化,其他群体之间分化程度较小,利用Nei's无偏遗传距离构建群体间的聚类树,结果显示洋下群体与其他群体间的遗传距离最远,这可能是由于人工育苗中的倾向性亲本选择导致的。结合形态与遗传多样性的分析结果,发现皱纹盘鲍不同养殖群体由于人工育苗有倾向性的选择使群体间出现了一定程度的分化,群体间形态差异受到养殖环境与遗传的双重作用。 3、利用线性测量的方法研究了皱纹盘鲍、绿鲍及其正反交子代、回交子代的形态差异,结果显示5个群体的形态差异存在明显区别,可以通过形态差异大致区分开这五个群体。24对微卫星引物分析结果表明,五个群体两两之间存在明显的遗传分化,且绿鲍群体的遗传多样性明显低于其他四个群体,其他四个群体的遗传多样性相对较高;哈迪温伯格平衡分析结果显示三个杂交后代群体中有较多数位点显著偏离哈迪温伯格平衡,但是皱纹盘鲍、绿鲍群体中绝大多数位点都符合哈迪温伯格平衡。而结合形态与遗传多样性分析的结果,推测这五个群体的壳形受母系遗传的影响比较大,且受遗传的影响大于养殖环境的影响。 4、通过全基因组重测序技术开发SNP标记,对222只家系群体的形态学性状进行全基因组关联分析。经过质控后共有1431014个SNP标记用于关联分析,关联分析的结果显示共有159个SNP标记与8个形态性状显著相关,通过注释找到了CUBN、EGF-like、FGFR、CALM、PLC等与壳生长及生物矿化过程相关的基因,为后续的研究提供了新的参考。 5、利用71只鲍鱼重测序的数据,初步筛选出了韩国、日本北方、日本南方、中国南方、中国北方五个地理群体特异性的SNP标记共102个,并初步分析了这些标记的特征,结果显示利用这102个标记能有效的将这五个地理群体区分开。