摘要
背景: 口腔鳞状细胞癌(tonguesquamouscellcarcinoma,OSCC)是一种鳞状上皮起源的实体瘤,在全世界范围内每年约有40万新发病例。2012年,全世界死于该病的人数约为145000人,死亡率为1.8%。目前,外科手术仍是OSCC的主要治疗方式,放化疗则是OSCC重要的辅助治疗方法,多用于晚期肿瘤。近年来,随着综合诊治水平的提高,OSCC患者的生存预后有了很大的改善。但目前在临床上仍存在化疗耐药性导致OSCC患者预后差的问题。本研究拟通过高通量基因表达数据库研究口腔鳞状细胞癌顺铂耐药的潜在分子机制,分析OSCC中耐药的差异表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs),及其相互调控关系,以期阐明OSCC化疗耐药的分子基础,为OSCC患者治疗提供理论基础和个体化精准治疗靶点。 方法: 在GEO数据库中检索并下载“OSCC顺铂耐药”相关的数据集;使用GEO2R分析基因表达谱;在线绘制韦恩图以获得耐药的DEGs;使用DAVID软件对DEGs进行功能富集分析和KEGG通路分析;使用STRING数据库构建蛋白质–蛋白质相互作用网络;利用miRDB网站进行miRNA靶基因预测;最后,利用ProteinAtlas和cBioportal分析潜在的功能基因在肿瘤中的表达情况及其对患者生存的影响。 结果: GEO筛选获得“OSCC顺铂耐药”相关数据集GSE111585和GSE115119,以p值<0.01且差异倍数|logFC|>1为筛选条件,获得了48个上调DEGs和49个下调DEGs。DEGs主要富集在细胞增殖调节、趋化因子活性、mRNA切割和多腺苷酸化特异性因子复合物等方面,可能通过上述通路影响OSCC顺铂敏感性。进一步使用在线数据库STRING来构建蛋白互作网络。并以互作分数>300为界,筛选核心基因,分别是:NOTCH1、JUN、CTNNB1、CEBPA和ETS1。继而利用miRDB探究调控核心基因的miRNA,发现hsa-miR-200c-3p、hsa-miR-200b-3p、hsa-miR-429和hsa-miR-139-5p可以同时调控NOTCH1、JUN和ETS1。其中hsa-miR-200c-3p、hsa-miR-200b-3p、hsa-miR-429均属于miR-200家族成员。生存分析发现CTNNB1高表达患者预后较差;CEBPA高表达患者预后较好。 结论: 本研究发现,在OSCC耐药细胞株中,NOTCH1、JUN、CTNNB1、CEBPA和ETS1等为调控口腔鳞癌顺铂耐药的关键基因,而miR-200家族可能通过调控核心基因NOTCH1、JUN和ETS1影响逆转OSCC细胞耐药,是治疗OSCC顺铂耐药患者的潜在靶点。