摘要
BROTHER OF FT AND TFL1(BFT)被称为FLOWERING LOCUS T(FT)和TERMINAL FLOWER1(TFL1)的兄弟,在植物开花通路中发挥着重要的调控作用。在盐胁迫下,拟南芥BFT蛋白在顶端分生组织中同bZIP转录因子FD互作,形成复合物调控开花转变。实验室前期构建了新陆早33叶组织的酵母双杂cDNA文库,并从中筛选出一个与陆地棉开花促进因子GhFT1蛋白互作的天冬氨酸类似蛋白(Aspartic proteinases,APs),该蛋白酶基因在植物生长发育、抗病及逆境胁迫过程中起着重要作用。 目的:全基因组鉴定棉花BFT和GhAPs基因,通过生物信息学分析,初步预测GhAPs可能存在的生物学功能;利用蛋白互作和转基因拟南芥研究,探索GhBFT在开花调控中的功能。 方法:基于最近更新的棉花基因组数据库,鉴定棉花BFT和GhAPs基因;RT-PCR技术克隆GhBFT1和GhBFT2基因;实时荧光定量PCR技术检测GhBFT1和GhBFT2基因表达特征;酵母双杂交(Yeast two-hybrid,Y2H)和双分子荧光互补技术(Bimolecular fluorescent complimentary assay,BiFC)技术共同探究GhBFT蛋白与陆地棉FD蛋白之间的相互作用;构建植物表达载体35S:GhBFT1,采用农杆菌介导的花滴法转化野生型拟南芥。 结果:1、棉花BFT基因的全基因组分析:(1)棉花数据库中共鉴定了12个BFT同源基因,其中四倍体陆地棉和海岛棉中均发现了4个BFT基因,二倍体亚洲棉和雷蒙德氏棉中各有2个BFT基因;(2)棉花BFT基因均由4个外显子和3个内含子组成,且1号和4号外显子相对较大;BFT蛋白间理化性质相似性较高,且具有相同的保守基序和保守结构域(D-P-D-x-P;G-x-H-R);(3)克隆的GhBFT1和GhBFT2基因均来自于D亚基因组,其ORF长度分别为525bp和522bp;(4)GhBFT1和GhBFT2基因均在陆地棉叶中表达量最高,花中次之,且GhBFT1在各组织中表达量显著高于GhBFT2;(5)GhBFT1和GhBFT2不同程度地响应盐、干旱、ABA及高低温胁迫,并具有相似的表达特征;(6)Y2H和BiFC实验证明GhBFT1和GhBFT2均能与陆地棉GhFD1、GhFD2、GhFD3和GhFD4蛋白互作;(7)35S:GhBFT1过表达拟南芥,导致其开花延迟,莲座叶数目增加。 2、棉花APs基因的全基因组分析:(1)陆地棉中共鉴定了87个GhAPs基因,其中83个拥有两个完整的ASP保守位点;(2)系统进化树将其聚类为典型(Typical)(A)、类珠型(Nucellin-like)(B)和非典型(Atypical)(C)三大类,各亚组成员在基因结构、保守基序及氨基酸序列间存在一定的差异;(3)染色体定位显示GhAPs基因在除A04外的所有染色体上均有分布,且发现5对串联重复基因;(4)共线性分析发现,GhAPs基因间存在大量的共线性,且每个GhAPs基因与1~4个基因间存在共线性关系;(5)启动子顺式作用元件预测显示,GhAPs基因启动子含有光、激素(ABA、GA、IBA和MeJA)、逆境胁迫(干旱、低温、抗氧化、防御和应激性)、昼夜节律、分生组织表达、胚乳表达和细胞周期调控等相关元件;(6)组织表达分析结果表明,GhAPs在陆地棉的根、茎、叶、花瓣、雌蕊、萼片、苞片、花托、花药和花丝及不同发育时期的胚珠和纤维中均不同程度表达。 结论:1、棉花基因组中共含有12个BFT基因,陆地棉和海岛棉中均含有4个,亚洲棉和雷蒙德氏棉中各有2个;GhBFT1和GhBFT2在叶和花中表达量较高,响应盐、干旱、ABA及高低温胁迫;GhBFT1和GhBFT2与陆地棉中4个FD同源蛋白互作;拟南芥中异位过表达GhBFT1,导致转基因拟南芥延迟开花,表明GhBFT可能与FT竞争结合FD蛋白,从而抑制开花转变。 2、陆地棉中共鉴定了87个可能的GhAPs基因家族成员,分为A、B和C三大亚组,各亚组成员基因结构、保守基序和氨基酸序列间存在差异性,预示其可能具有功能多样性;GhAPs在进化过程中可能发生了基因复制事件;GhAPs在棉花各组织和发育时期均表达,暗示其可能参与调控陆地棉种子萌发、胚珠发育及花药形成等生长发育阶段;启动子上富含响应干旱、低温、伤口胁迫及ABA、GA和MeJA等激素相关的元件,表明GhAPs在应对多种胁迫过程中发挥重要作用。