摘要
背景和目的：肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)患者预后不佳，小分子非编码RNAs(microRNAs, miRNAs)在肺鳞癌发生发展以及诊疗中的作用也逐渐开始受到学者们的关注。为了进一步丰富miRNAs在肺鳞癌诊疗中的认识，探索与肺鳞癌发生发展相关的关键miRNAs，及其对肺鳞癌患者预后的影响，我们使用生物信息学方法对肺鳞癌miRNAs的表达进行了研究分析。 方法：利用R软件(RStudio Version 1.1.463)整合分析从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)数据库中下载转录的表达谱数据，从中筛选差异表达基因miRNAs(differential expression genes，DEGs)；根据入组标准在基因芯片数据库(Gene Expression Omnibus，GEO)中筛选数据集作为验证；利用单因素和多因素的Cox回归分析方法分析DEGs对肺鳞癌患者预后的影响；运用DAVID数据库对DEGs分别进行GO注释和KEGG富集分析，绘制相关富集功能的相互作用通路图。 结果：(1)在TCGA数据库的肺鳞癌miRNAs表达数据分析中，我们共筛选出52个DEGs，其中上调表达的有38个，下调表达的有14个；(2)通过筛选GEO数据库中符合条件的数据集并做差异分析，最终得到4个上调表达miRNAs(hsa-mir-205、hsa-mir-210、hsa-mir-182、hsa-mir-224)和1个下调表达miRNA(mir-451)；(3)生存分析结果显示miR-210的表达水平与患者的总生存时间(overall survival，OS)显著相关，在miR-210上调表达组中，未放疗患者的OS显著优于放疗患者；(4)功能富集中，miR-210富集的功能主要集中在细胞增殖的正、负调控，DNA转录和胆碱代谢等方面；信号通路主要集中在血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)信号通路，缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-I,HIF-1)信号通路，丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases, MAPK)信号通路等。 结论：miR-210是LUSC患者的独立预后因素，miR-210低表达状态下的患者经过研究分析有更好的预后；并且在miR-210上调表达组中，患者对于放疗应答较差，结合功能富集中miR-210与HIF-1通路的关系，以及HIF-1通路与放射耐受性的联系，miR-210的上调表达状态可能会影响患者对放疗的反应，也提示miR-210可能成为未来LUSC患者临床治疗决策选择的重要参考。
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