首页|MiR-106b及其靶基因ATF5单核苷酸多态性与肝细胞癌易感性的关联研究

MiR-106b及其靶基因ATF5单核苷酸多态性与肝细胞癌易感性的关联研究

蒋燕霁

MiR-106b及其靶基因ATF5单核苷酸多态性与肝细胞癌易感性的关联研究

蒋燕霁1
扫码查看

作者信息

  • 1. 广西医科大学
  • 折叠

摘要

背景和目的:肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC),简称肝癌,是全世界最常见的恶性肿瘤之一,因其恶性程度极高、病情进展快、预后差,被称为“癌中之王”。微小RNA(microRNA,miRNA)是一类长约21-25个核苷酸的非编码RNAs,通过碱基互补与靶mRNA分子3’端非翻译区(3’-UTR)结合,导致mRNA降解或翻译抑制,最终参与肿瘤细胞的增殖、分化和凋亡等多个生物学过程。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由于单个核苷酸的变异所引起的DNA序列的多态性。miRNA自身SNPs和miRNA靶基因3’-UTR的SNPs可通过影响miRNA的结合能力或者改变结合位点,调控个体对肿瘤的易感性。miR-106b作为miR-106b-25家族中的一员,可促进肿瘤细胞增殖和血管生成,抑制肿瘤细胞凋亡,参与肿瘤的发生发展。本研究旨在探讨广西地区人群中miR-106b及其靶基因单核苷酸多态性与HCC易感性的关系,识别出HCC相关的遗传易感性SNP,为HCC高危人群的筛选和一级预防以及早期诊断等提供理论依据。 方法:采用以医院为基础的病例对照研究方法,收集到自2007年1月至2011年4月在广西医科大学第一附属医院、附属肿瘤医院及桂林医学院附属医院治疗的HCC新发病例813例和非肿瘤对照896例。本研究通过NCBIdbSNP数据库和NIEHS数据库筛选到了位于miR-106b上的候选SNPs:rs2261360(G>T)和rs1527423(A>G);然后利用miRNASNP2.0数据库筛选到了位于ATF5基因3’-UTR上的miR-106b结合位点rs8647(G>A)。候选SNPs检测采用SequenomMassARRAY基因分型平台。运用多因素Logistic回归方法计算不同基因型发病风险的比值比(Odds Ratios,OR)及其95%可信区间(95%confidence intervals,95%CI),分析各SNP与HCC易感性关系及基因-环境因素交互作用。 结果:病例组和对照组的年龄、性别频率分布差异无统计学意义(P>0.05),吸烟史、饮酒史及HBV感染在病例组中的频率高于对照组(P<0.001)。本研究对照组中的候选SNPs位点的基因型频率均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05)。经校正年龄、性别、吸烟史、饮酒史以及HBV感染等影响因素后,发现miR-106brs2261360位点与HCC的发病风险显著相关,携带TG基因型的个体发生HCC的风险是携带GG基因型个体的0.64倍(TGvs.GG:OR=0.64,95%CI=0.46-0.88,P=0.006);在显性模型中,携带rs2261360位点T等位基因的个体发生HCC的风险显著降低(TG/TTvs.GG:OR=0.71,95%CI=0.53-0.96,P=0.023)。但未发现单个miR-106brs1527423及ATF5基因rs8647位点多态性与HCC发病风险显著相关(P>0.05)。进一步对与HCC发病风险存在统计学关联的rs2261360位点进行分层分析,以年龄、性别、吸烟史、饮酒史以及HBV感染等因素作为分层因素,发现在年龄≤49岁、男性、无吸烟史、无饮酒史、HBV感染(+)人群中,携带TG/TT基因型的个体发生HCC的风险显著降低(年龄≤49岁:OR=0.49,95%CI=0.30-0.78,P=0.003;男性:OR=0.66,95%CI=0.48-0.91,P=0.011;无吸烟史:OR=0.61,95%CI=0.42-0.89,P=0.010;无饮酒史:OR=0.57,95%CI=0.40-0.83,P=0.003;HBV感染(+):OR=0.44,95%CI=0.27-0.72,P=0.001),基因-环境因素交互作用结果表明rs2261360位点多态性与HBV感染存在交互作用(P<0.05)。我们进一步分析SNP-SNP之间的联合作用对HCC发病风险的影响。我们将rs2261360位点GG基因型、rs1527423位点GA/GG基因型和rs8647位点GG基因型定义为假设危险基因型(简称危险基因型),对rs2261360位点、rs1527423位点及rs8647位点的联合作用进行分析,结果发现,联合危险基因型在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义(P<0.05);经校正年龄、性别、吸烟史、饮酒史以及HBV感染等影响因素后,携带1-3个危险基因型的个体发生HCC的风险是不携带危险基因型个体的1.52倍(95%CI=1.09-2.12,P=0.013)。分层分析结果表明,在男性、无吸烟史、无饮酒史、HBV感染(+)人群中,携带1-3个危险基因型的个体患HCC的风险增加(男性:OR=1.57,95%CI=1.10-2.23,P=0.013;无吸烟史:OR=1.61,95%CI=1.06-2.45,P=0.027;无饮酒史:OR=1.73,95%CI=1.16-2.60,P=0.008;HBV感染(+):OR=1.70,95%CI=1.06-2.73,P=0.029),但未发现危险基因型与年龄、性别、吸烟史、饮酒史及HBV感染等因素有交互作用(P>0.05)。 结论:在广西地区人群中,单个miR-106brs2261360位点可能影响HCC遗传易感性。miR-106brs2261360、rs1527423和ATF5基因rs8647位点的危险基因型联合作用可协同增加个体罹患HCC的发病风险。

关键词

肝细胞癌/miR-106b/ATF5基因/单核苷酸多态性/病理易感性

引用本文复制引用

授予学位

硕士

学科专业

流行病与卫生统计学

导师

余红平

学位年度

2020

学位授予单位

广西医科大学

语种

中文

中图分类号

R73
段落导航相关论文