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基于MRI的影像组学预测脑胶质瘤Ki-67表达状态的应用研究

刘晓岚

基于MRI的影像组学预测脑胶质瘤Ki-67表达状态的应用研究

刘晓岚1
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作者信息

  • 1. 大连医科大学
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摘要

目的: 探讨基于平扫T2WI及增强T1WI序列的影像组学特征,在术前预测脑胶质瘤患者Ki-67表达状态的应用价值。 方法: 一.一般资料及图像获取: 回顾性分析本院81例脑胶质瘤患者,其中男48例,女33例,年龄18~94岁,平均(55±13.62)岁。所有患者均手术并获得病理结果,依据病理结果分为:胶质母细胞瘤37例,间变型星形细胞瘤10例,弥漫型星形细胞瘤9例,胶质母细胞瘤(IDH-1野生型)6例,间变型少突胶质细胞瘤6例,星形细胞瘤4例,少突星形细胞瘤2例,多形性胶质母细胞瘤2例,少突胶质细胞瘤1例,胶质瘤(胶质细胞非典型增生)1例,肥胖型星形细胞瘤1例,纤维型星形细胞瘤1例,间变型少突胶质星形细胞瘤1例。所有患者术前均行颅脑MRI检查,包括平扫T1WI、T2WI及T1WI增强成像。 患者纳入标准:(1)患者未行放化疗及免疫治疗、外科切除等任何形式的治疗;(2)患者术前均接受MRI检查扫描,且MRI图像清晰,病灶显示良好;(3)术中冰冻及术后病理检查明确为胶质瘤,临床资料完整;(4)患者知情同意。 患者排除标准:(1)患者术前行放化疗、免疫治疗等,或术后复发者;(2)存在MRI检查禁忌者;(3)MRI图像伪影较重,病灶显示欠佳者;(4)临床资料不完整。 二.病理资料 所有入组患者在手术切除后一周内通过免疫组织化学法(Envision法)来进行Ki-67的测量,计算阳性染色的恶性细胞占细胞总数的百分比,即标记指数(Labeling index,LI),LI=阳性细胞数/细胞总数×100%。本研究根据Ki-67指数将胶质瘤患者分为两组:Ki-67低表达组(Ki-67≤25%)及高表达组(Ki-67>25%),低表达组有45例,高表达组有36例。 三.图像处理及组学分析 将获取的磁共振图像以DICOM格式分组上传至放射组学平台,分别在平扫T2WI及增强T1WI图像上对病灶进行逐层手动勾画感兴趣区,获得感兴趣容积(volume of interest,VOI),通过组学分析及特征计算,提取影像组学特征值,经过方差选择法(VarianceThreshold)、单变量选择法(SelectKBest)及最小绝对收缩算子(Lasso)三次降维方法进行特征值的筛选,最终分别得出最优特征值。然后随机将所有病灶80%的VOI作为训练组,20%的VOI作为测试组,采用六种分类器分别对所提取的特征值进行机器学习,六种分类器包括:K近邻(k-Nearest Neighbor,KNN)、极限梯度增强树(Extreme Gradient Boosting,XGBoost)、支持向量机(Support Vector Machine,SVM))、随机森林(Random Fores,RF)、决策树(Decision Tree,DT)以及逻辑回归(Logistic Regression,LR),通过分析其ROC曲线下面积(AUC)、95%置信区间、特异度(Specificity)及敏感度(Sensitivity)等指标来评价各个分类器所构建模型的诊断效能。 结果: 通过比较分析分别基于平扫T2WI联合增强T1WI、平扫T2WI、增强T1WI序列图像的6个分类器所构建模型的AUC值可以得出以下信息: 1.基于平扫T2WI联合增强T1WI序列的影像特征,由SVM及LR分类器所构建预测模型的AUC值较好,其中LR分类器的AUC值最佳: (1)LR分类器结果:Ki-67低表达AUC为0.873(95%CI:0.76-0.99),灵敏度0.78、特异度1.00;Ki-67高表达AUC为0.873(95%CI:0.76-0.99),灵敏度1.00、特异度0.78; (2)SVM分类器结果:Ki-67低表达AUC为0.778(95%CI:0.60-0.95),灵敏度0.56、特异度1.00;Ki-67高表达AUC为0.778(95%CI:0.60-0.95),灵敏度1.00、特异度0.56; 2.基于平扫T2WI序列的影像特征,由LR分类器所构建的预测模型的AUC值最佳,Ki-67低表达AUC为0.778(95%CI:0.55-1.00),灵敏度0.78、特异度0.75;Ki-67高表达AUC为0.778(95%CI:0.55-1.00),灵敏度0.75、特异度0.78; 3.基于增强T1WI序列的影像特征,由KNN分类器所构建的预测模型的AUC值最佳,Ki-67低表达AUC为0.590(95%CI:0.35-0.83),灵敏度0.56、特异度0.63;Ki-67高表达AUC为0.590(95%CI:0.35-0.83),灵敏度0.63、特异度0.56。 通过比较它们的AUC值,我们可以发现基于平扫T2WI联合增强T1WI序列的LR分类器所构建的预测模型的AUC值最高,其具有更高的诊断效能,高于单基于平扫T2WI及单基于增强T1WI序列所构建的预测模型,其提取的最优特征值包括:一阶特征(Skewness、10Percentile、Median、Energy、TotalEnergy),灰度依赖矩阵(LargeDependenceHighGrayLevelEmphasis、DependenceVariance、LargeDependenceLowGrayLevelEmphasis),灰度区域大小矩阵(HighGrayLevelZoneEmphasis)。此外,单基于增强T1WI序列的KNN分类器所构建的预测模型的AUC值最低,对于预测Ki-67表达状态的诊断效能最差,且其灵敏度及特异度均不是很好。 结论: 1.基于平扫T2WI联合增强T1WI序列、基于平扫T2WI序列的影像组学模型可以预测胶质瘤Ki-67的表达状态,其中基于平扫T2WI联合增强T1WI序列的影像组学模型的预测效能较好。 2.基于平扫T2WI联合增强T1WI序列、基于平扫T2WI序列的影像组学模型,在术前脑胶质瘤Ki-67表达状态的无创预测方面有一定的潜能。

关键词

脑胶质瘤/疾病诊断/Ki-67蛋白/蛋白表达/预测模型/磁共振成像

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授予学位

硕士

学科专业

影像医学与核医学

导师

郭冬梅

学位年度

2020

学位授予单位

大连医科大学

语种

中文

中图分类号

R73
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