摘要
目的：鼻咽癌是我国是南亚、北非和华南地区最常见的头颈部恶性肿瘤之一，近年来，随着鼻咽癌的发病率逐年升高，了解鼻咽癌的分子机制刻不容缓，本研究通过基因芯片技术及生物信息学方法筛选鼻咽癌的7个关键基因，使我们更加清楚的了解到了鼻咽癌发生发展的分子生物学机制。 方法：首先我们在GEO数据库里下载了数据集GSE12452与GSE13597，随后我们对GSE12452进行差异基因分析(DEGs)，然后将该结果纳入另一数据集GSE13597中构建加权基因共表达网络并进行模块筛选，筛选出最具有研究意义的基因模块，并且对模块进行了GO和KEGG富集分析，最后进行蛋白互作网络分析，综合两者的结论得出最终的核心基因。然后将得出的核心基因结果纳入数据集GSE53819进行差异基因分析，最后对该结果予以组织验证。 结果：经过对基因组GSE12452的差异基因分析得出838个差异基因，将该结果纳入另一数据集GSE13597中构建加权基因共表达网络后，得到了四个模块，通过模块-特征关系分析，我们得出草绿色模块在肿瘤的病理分期中具有最高的基因显著性，我们确定了草绿色模块为我们研究的重点模块，随后通过GO分析和KEGG通路富集分析了解了草绿色模块的分子功能和生物学过程，最后分析蛋白互作网络，对差异基因的蛋白相互作用进行可视化分析，选取了相关性最高的前十位的核心蛋白，综合两者的结论我们最终得出7个相关性最显著的核心基因，而将该结果纳入数据集GSE53819分析差异基因，发现7个基因在这一数据集中同样具有明显的差异性，随后组织学验证的结果亦与其一致。 结论：通过基因芯片技术及系统的生物信息学分析，对数据集GSE12452及GSE13597进行了差异表达基因分析、构建加权共表达网络等一系列研究，并且最终筛选出7个核心基因，他们分别是：NCAPG,CCNA2,CDC45,TTK,RACGAP1,CCNB1,KIF11。其中NCAPG、CDC45、TTK、KIF11四个基因是首次发现并与鼻咽癌密切相关的核心基因，并且对该结果使用数据集GSE53819予以了生物信息学及使用RT-qPCR的方法予以组织学验证。为以后对鼻咽癌发病机制的研究提供了新的思路，同时它们也是鼻咽癌新的潜在治疗靶点。
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