摘要
目的:我们采用16SrDNA测量序列法观察脾虚湿盛证寻常型银屑病患者口服健脾解毒汤前后肠道菌群的变化。通过试验组治疗前后与健康对照组三组,两两组合对比,探索中药对于银屑病肠道菌群的影响。 方法:收集20例脾虚湿盛证寻常型银屑病患者和20例健康对照者的粪便标本,并采用16SrDNA检测技术分析。 结果:1.所纳入的20例患者男女性别比例为1.86∶1年龄平均为43.9岁;比较身体各部位的严重程度可以发现:躯干、下肢分别与头比较有差异,各部分鳞屑较其他各部位均明显,红斑及浸润情况身体各部未见明显差别。2.样本经过质控有效率以97%的一致性(Identity)将序列聚类成为OTUs(Operational Taxonomic Units),共得到3,645个OTUs,然后对OTUs序列与Silva138数据库进行物种注释。注释结果中,共有1,589(43.59%)个OTU注释到属水平。在门水平上,我们发现拥有主要比例的为:Firmicutes(厚壁菌门)、Proteobacteria(变形菌门)、Actinobacteriota(放线菌门);在纲水平上主导的为Clostridia(梭状芽胞杆菌纲)、Gammaproteobacteria(γ-变形菌纲)、Actinobacteria(放线菌纲);在目水平上的优势物种为Enterobac terales(肠杆菌目)、Lachnospirales(毛螺菌目)、Bifidobacteriales(双歧杆菌目);在科水平上的优势物种为Enterobacteriaceae(肠杆菌科)、Lachnospiraceae(毛螺菌科)、Bifidobacteriaceae(双歧杆菌科);在属水平上的优势物种为Escherichia-Shigella(大肠杆菌志贺菌属)、Bifidobacterium(双歧杆菌属)、Bacteroides(拟杆菌纲属);优势种为Escherichia_coli(大肠埃希菌)、Bacteroides_vulgatus(普通拟杆菌)、Ruminococcus(瘤胃球菌科)。3.Alpha Diversity可以确定不同菌群间的整个群落结构是否存在明显差异,通过常规的T-test检验发现Bacteroidota(拟杆菌)、Bifidobacteriales(双歧杆菌目)在试验组治疗前后两组间的显著性(p<0.05),健康对照组与试验组群落构成存在差异性。通过对A-B-C的LEfSe分析,发现LDA score>4的biomarker,即组间丰度具有统计学差异的biomarker共有11个。Beta Diversity利用PCoA、PCA进行组间差异分析,从中发现健康对照组与试验组治疗前后距离具有一定差距,说有明显差异性。 结论:此次研究发现银屑病患者的肠道菌群结构与健康对照组存在差异性,口服健脾解毒汤治疗后试验组前后肠道菌群有差异;本课题主要为探讨健脾解毒汤对银屑病患者肠道微生物的起到调节作用提供了一种新的方法。