摘要
第一部分GTF2I基因多态性与中国汉族人群类风湿性关节炎关联研究 背景:类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一类常见的系统性自身免疫疾病,以慢性滑膜炎症、关节骨和软骨的破坏、关节功能丧失为主要特征。RA患者的自身免疫系统会错误地攻击健康组织,持续性的疾病活动还会导致神经疾病、心血管疾病等多种并发症,是人们失去劳动力和致残的主要原因,严重时危害生命。RA的发病机制尚未阐明,但大量研究表明遗传因素在RA的发病中起到重要的作用。GTF2I基因编码转录因子II-i(transcription factor II-i,TFII-i),参与多种信号通路,在基因转录中起到重要的调节作用。GTF2IRD1-GTF2Iloci是亚洲人群中特有的易感基因区域,其单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs117026326和rs73366469分别与干燥综合征(Sjogren Syndrome,SS)和系统性红斑狼疮(Systemic Lupus Erythematosus,SLE)易感性有较强的关联性。近期的GWAS研究表明,rs117026326、rs73366469与亚洲人群中RA的发病相关,但是它们与中国汉族人群RA的关联性尚未得到验证,并且GTF2IRD1-GTF2I基因影响RA的机制尚不明确。 目的:本研究旨在探究GTF2IRD1-GTF2Irs117026326和rs73366469SNPs与中国北方汉族人群RA的关联性,进一步探究GTF2I基因在RA发病中的作用,以及该基因影响RA易感性的潜在机制。 方法:我们于吉林大学第一医院收集了240例RA患者和760例健康对照,通过磁珠法分离全血中基因组DNA,使用TaqMan实时定量PCR鉴定SNP位点基因型;利用Ficoll密度梯度离心法分离血液中外周血单个核细胞(Peripheral Blood Mononuclear Cell,PBMC),进行RNA提取和逆转录,利用Real-timeqPCR技术检测GTF2ImRNA表达水平;提取EBV细胞系、Jurkat细胞系、U937细胞系和K562细胞系的核蛋白提取物,利用凝胶迁移实验(EMSA)探究SNP位点多态性与结合核蛋白提取物能力的关联。 结果:1、rs117026326和rs73366469的等位基因频率和基因型频率均符合Hardy-Weinberg遗传平衡检验(PHWE>0.05);2、rs117026326在健康对照和RA中,C等位基因频率分别是0.850和0.774,T等位基因频率分别为0.150、0.226,均具有显著差异(P>0.05);rs73366469在健康对照和RA患者中,T等位基因频率分别为0.815和0.736,C等位基因频率0.185和0.264,均具有显著差异(P>0.05),rs117026326和rs73366469均与中国北方汉族人群RA的易感性相关(OR=1.632,P=0.001;OR=1.599,P=1.32×10-4);3、在RA患者的PBMC中,rs117026326和rs73366469的多态性与GTF2ImRNA表达水平均不相关(P>0.05);4、在EBV细胞系、Jurkat细胞系、U937细胞系和K562细胞系的核蛋白提取物中,rs117026326和rs73366469的多态性均不影响其与核提取物的结合。 结论:rs117026326的等位基因T和rs73366469的等位基因C与中国北方汉族人群RA的易感性增加相关,rs117026326和rs73366469位点多态性与GTF2ImRNA表达水平不相关,也与其结合核蛋白提取物的能力不相关。 第二部分TNIP1基因多态性与中国汉族人群乙肝病毒感染关联研究 背景:肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是全球第五大常见恶性肿瘤,中国肝癌的发病率和死亡率占全球50%以上,其中超过80%的肝癌是由乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)慢性感染引起的。HBV感染是世界最常见的慢性病毒感染之一,全球约有2.57亿HBV慢性感染者,每年约有100万人死于HBV感染相关的肝脏疾病。在宿主遗传因素与HBV感染相关性的研究中,发现炎症因子中的多个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与HBV感染相关。TNIP1SNPs与许多自身免疫病和肝脏疾病相关。TNIP1rs2233290会导致ABIN1氨基酸的改变(151Pro→Ala),rs2233290与慢性HBV感染的关联性尚无报道。 目的:本研究旨在探究TNIP1rs2233290与中国北方汉族人群慢性HBV感染的关联情况,进一步探究该SNP在慢性HBV感染中的作用及潜在机制。 方法:我们于吉林大学白求恩第一医院收集了100例慢性HBV感染者,通过磁珠法分离全血中基因组DNA,使用Sanger法鉴定SNP位点基因型;通过瞬时转染法将rs2233290不同基因型的质粒转染进HepG2细胞中,利用Westernblot技术和qPCR检测ABIN1蛋白表达量和TNIP1mRNA表达量;使用TNFɑ诱导转染后细胞,通过Westernblot检测内源IκBɑ、p-IκBɑ表达量,寻找合适的NF-κB诱导条件;共表达A20蛋白和rs2233290不同基因型的质粒,探究rs2233290风险变异对NF-κB通路的影响。 结果:1、在100例慢性HBV感染者中,rs2233290MAF=0.005<0.01,不具有统计学意义。2、将不同基因型TNIP1基因转染至HepG2细胞后,与G/G(Non-risk)基因型和C/C(Risk)基因型之间ABIN1蛋白表达量和TNIP1mRNA无显著差异。3、利用TNFɑ诱导HepG2细胞NF-κB信号,20ng/mlTNFɑ诱导2h是最适诱导条件,G/G(Non-risk)基因型和C/C(Risk)基因型表的蛋白均可以抑制NF-κB信号通路,但两者之间无显著差异。 结论:TNIP1rs2233290在中国北方汉族人群慢性HBV感染者中不具有统计学意义,rs2233290的G/G基因型和C/C基因型对ABIN1蛋白的表达量和NF-κB通路调控作用均无显著差异。