首页|基于DNA甲基化的鲜切富士苹果褐变差异研究

基于DNA甲基化的鲜切富士苹果褐变差异研究

唐甜甜

基于DNA甲基化的鲜切富士苹果褐变差异研究

唐甜甜1
扫码查看

作者信息

  • 1. 中国农业科学院
  • 折叠

摘要

酶促褐变严重制约鲜切果蔬行业的发展,而苹果作为鲜切水果重要的材料之一,褐变问题尤为严重。本文以富士苹果(Malus domestica Borkh.)芽变品种‘条红型(易褐变,T)’和‘片红型(不易褐变,P)’为试验材料,测定两种苹果在切割后0h和2h的褐变指数(Browning index,BI)、多酚氧化酶(Polyphenoloxidase,PPO)、苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonialyase,PAL)、抗氧化相关酶系、抗坏血酸(Ascorbic acid,AsA)、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)、活性氧(Reactive oxygen species,ROS)、总酚及10种多酚单体含量和多酚合成相关基因表达量,初步探究两种苹果褐变差异的原因。进一步使用甲基化抑制剂5-azaC处理T型鲜切苹果,褐变程度降低,同时对0h和2h鲜切苹果进行整体DNA甲基化(5mC%)水平、甲基化相关基因表达量测定及全基因组DNA甲基化测序,探讨DNA甲基化在苹果酶促褐变中的作用,建立DNA甲基化水平与褐变的关系。 主要研究结果如下: (1)鲜切苹果在贮藏2h后,BI显著升高,T型苹果褐变后的BI显著高于P型苹果,两种苹果褐变差异与PPO活性及总酚含量变化不相关,且T型和P型苹果之间的PAL活性、O2-含量无显著差异。与T型苹果相比,P型苹果有较高的过氧化物酶(Peroxidase,POD)、超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)活性和AsA含量等抗氧化指标。 (2)利用靶向代谢组学检测多酚单体含量发现,两种苹果中主要含有6种多酚单体,其中P型和T型苹果之间的儿茶素、表儿茶素、绿原酸和原花青素B2含量没有显著差异,金丝桃苷和根皮苷含量差异显著。利用qPCR技术测定多酚合成相关基因表达发现,与P型苹果相比,T型苹果在褐变期间大多数多酚合成相关基因显著上调。相关性分析发现,BI与金丝桃苷含量显著负相关,与MDA含量和7个多酚基因表达量显著正相关。 (3)UPLC-MS/MS检测苹果基因组整体DNA甲基化(5mC%)水平发现,T型苹果褐变后5mC含量显著高于P型苹果,进一步利用qPCR技术测定甲基化相关基因表达量发现,与P型苹果相比,易褐变的T型苹果中DNA甲基化转移酶基因具有更高的表达水平,去甲基化酶基因表达量较低。相关性分析发现,BI与5mC%、CMT3和CMT3c表达量相关,说明褐变与甲基化水平升高的因素呈很强的正相关。 (4)DNA甲基化测序分析发现,与P型苹果相比,T型苹果褐变后各类型C(CG、CHG和CHH)位点的甲基化水平(66.86%、57.84%和37.77%)均高于褐变前(58.05%、48.91%和29.89%),苹果胞嘧啶甲基化主要发生在不对称CHH位点,褐变前P型和T型苹果mCHH位点占所有甲基化胞嘧啶的63.12%和60.98%。在代谢途径、次生代谢产物的生物合成和氨基酸代谢等通路上基因的超甲基化,可能会影响苹果褐变。 综上所述,本研究首次发现富士苹果褐变与PPO活性及总酚含量变化不相关,进一步证实了苹果褐变与DNA甲基化具有密切的正相关关系,甲基化水平越高,苹果褐变程度越高;同时绘制了苹果褐变前后的DNA甲基化图谱,从表观遗传学角度为我们提供了认识褐变的新视角,为酶促褐变机理研究和防控果蔬褐变提供理论依据。

关键词

鲜切苹果/褐变差异/DNA甲基化/PPO活性/总酚含量

引用本文复制引用

授予学位

硕士

学科专业

食品加工与安全

导师

王志东

学位年度

2021

学位授予单位

中国农业科学院

语种

中文

中图分类号

TS
段落导航相关论文