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安徽地区儿童志贺氏菌分子流行病学研究

孙雅婷

安徽地区儿童志贺氏菌分子流行病学研究

孙雅婷1
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作者信息

  • 1. 安徽医科大学
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摘要

目的: 了解安徽地区儿童志贺菌血清型分布情况、对抗菌药物的耐药情况和毒力基因,分析志贺菌携带毒力基因与抗药性之间的联系。 材料与方法: 材料:研究样本为安徽省三十四家医院2010年到2015年间从儿童(五岁及以下)粪便中分离的345株志贺菌。选用大肠杆菌ATCC25922作为药敏试验质控菌株,由安徽省细菌耐药中心保存。 方法: 1.对2010年到2015年间儿童(五岁及以下)粪便中分离的345株志贺菌,采用常规生化和VITKE-2Compact全自动微生物分析系统进行细菌的血清型鉴定。 2.选择琼脂稀释法检测345株志贺氏菌对18种抗菌药物的最低抑菌浓度(Minimalinhibitoryconcentration,MIC)。药敏试验的依据是美国临床和实验室标准协会(ClinicalLaboratoryStandardInstitute,CLSI)推荐的标准。 3.检测16种志贺菌毒力基因(VirulenceGenes,VRGs):ial、ipaC、ipaB、ipaD、ipaA、ipaH、set、sen、sat、virF、virB、icsA、icsB、sigA、pic、sepA。用煮沸法提取志贺菌DNA,通过聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction,PCR)扩增16对引物,16对引物分成五组分别扩增(组1:ial、ipaH、set、virF;组2:sen、sigA、pic、sepA;组3:icsA、icsB、virB;组4:ipaC、ipaB、ipaD、ipaA;组5:sat)。反应体系为:预混料Taq酶聚合物12.5ul,每种引物的上游引物0.5ul,下游引物0.5ul,DNA模板2ul,去离子水(ddH2O)6.5ul-9.5ul(使最终反应体系为25ul);反应条件为:95℃预变性15min;95℃变性45s,退火45s(退火温度:组1为57℃,组2为58℃,组3和组4为60℃,组5为59℃),72℃延伸1min,经过35个循环;72℃延伸10min。取8ulPCR产物在1%琼脂糖凝胶上加样(含0.5ug/ml的EB),电泳条件为电压150V电泳30分钟,通过凝胶成像系统观察并记录实验结果。 结果: 1.分析345株儿童志贺菌临床分离株发现,主要流行的血清亚型是福氏志贺菌(298株,86.4%)。宋内志贺菌是次在流行的血清亚型(44株,12.8%)。在福氏志贺菌中,源于安徽北部区域296株(99.3%),中部区域2株(0.7%)。在宋内志贺菌中,源于安徽北部区域43株(97.7%),中部区域1株(2.3%)。其中,相较于女童而言,福氏志贺菌的感染者多为男童(59.4%:40.6%,Plt;0.0001)。 2.在福氏志贺菌中:耐药性从高到低的前几位分别为氨苄西林(98.3%)、萘啶酸(97%)、四环素(93.3%)、氯霉素(88.6%)和环丙沙星(80.2%);敏感性从高到低的前几位分别阿米卡星(98.7%)、头孢西丁(94.6%)和哌拉西林/他唑巴坦(93.3%)。在宋内志贺菌中:所有菌株对氨苄西林和阿奇霉素全部耐药(100%)。其次为萘啶酸(97.7%)、庆大霉素(93.2%)、四环素(90.9%)和复方新诺明(88.6%);所有菌株对阿米卡星全部敏感(100%),其次为哌拉西林/他唑巴坦(97.7%)和亚胺培南(97.7%)。相比而言,福氏志贺菌对环丙沙星、氯霉素的抗药性比宋内志贺菌高;而宋内志贺菌对阿奇霉素、庆大霉素的抗药性比福氏志贺菌高。 3.345株儿童志贺菌临床分离株携带16种毒力基因的情况:(1)在分离的298株福氏志贺菌中:入侵相关基因中ipaH基因检出频率最高,为298株(100%),其次为ipaB基因296株(99.3%),ipaC基因295株(99.0%),ipaD基因295株(99.0%),ipaA基因295株(99.0%)和ial基因288株(96.6%);肠毒素基因中,set基因283株(95.0%),sen基因278株(93.3%);调控基因中,icsA基因296株(99.3%),icsB和virB基因检出频率相同,都为293株(98.3%),virF基因288株(96.6%);SPATEs基因中,sigA基因280株(94.0%),sat基因279株(93.6%),pic基因269株(90.3%),sepA基因267株(89.6%)。(2)在分离的44株宋内志贺菌中:入侵相关基因中,ipaH基因检出频率也是最高,为44株(100%),其次为ipaB基因43株(97.7%),ipaC基因42株(95.5%),ipaD基因41株(93.2%),ipaA基因41株(93.2%),最后为ial基因34株(77.3%);肠毒素基因中,sen基因39株(88.6%),而set基因在此次研究中的宋内志贺菌分离株均未检测到;调控基因中,icsA基因43株(97.7%),virB和icsB基因均为42株(95.5%),virF基因34株(77.3%);SPATEs基因中,sigA基因43株(97.7%),而sat和pic及sepA基因在研究中的宋内志贺分离株中均未测出。 结论: 1.福氏志贺菌和宋内志贺菌是安徽省儿童志贺菌主要流行血清亚群。北部区域的儿童具有更高的细菌性痢疾感染风险。 2.安徽省儿童临床分离志贺菌一般均为氨苄西林-萘啶酸-四环素的多重耐药株。其中,对于氟喹诺酮类抗菌药物,福氏志贺菌比宋内志贺菌具有更高的抗药性。 3.毒力基因ial、ipaA、ipaC、ipaD、virB、virF、set、icsB、pic、sepA阳性福氏志贺菌比阴性福氏志贺菌对CHL、CIP的抗药性强;set阳性福氏志贺菌比阴性福氏志贺菌对CRO和CAZ的抗药性强;毒力基因ial、virF、set、icsB、virB、pic、sepA阴性福氏志贺菌对GEN和AZM的抗药性更强。毒力基因阳性福氏志贺菌和宋内志贺菌耐药率相似,但对CRO和CAZ的耐药率更高。 4.志贺菌携带数个毒力基因与其抗药性有关。需更进一步分析其表达机制与志贺菌抗药性的遗传问题,由此可以更好的对志贺菌病的临床治疗做出指导。

关键词

志贺菌属/抗菌药物/毒力基因/耐药性/儿童患者

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授予学位

硕士

学科专业

内科学(传染病)

导师

李家斌

学位年度

2021

学位授予单位

安徽医科大学

语种

中文

中图分类号

R72
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