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甘蔗高糖突变体GXB9与母本品种B9间的形态、生理和分子特性比较研究

Qaisar khan

甘蔗高糖突变体GXB9与母本品种B9间的形态、生理和分子特性比较研究

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  • 1. 广西大学
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摘要

甘蔗(Saccharumspp.hybrid)是全球重要的经济作物,以其用于制糖及其茎秆中具有较高的糖分积累能力而闻名。世界上至少有106个热带和亚热带地区国家中进行甘蔗生产,约贡献全球70%的糖。为满足糖的不断增长需求,研发具有高蔗糖产量的甘蔗品种具有重要意义。 本研究对甘蔗高糖突变体无性系GXB9与其低糖母本品种B9的形态、生理、农艺性状以及转录组和蛋白质组学进行比较研究。甘蔗品种B9是1999年10月从巴西引进的品种,具有广谱适应性、高产的特性,但蔗糖含量相对较低。2013年10月15日,在B9品种的群体中发现了一个高糖突变体,并将其命名为GXB9。经数年田间试验,比较了GXB9和其原始母本B9的表型,结果证明两个基因型具有相似的形态特征,但蔗糖含量始终表现出显著差异,表明GXB9已经发生了突变。 为研究GXB9突变成因,本研究在正常环境下进行田间试验,比较分析GXB9与B9在形态、生理和农艺性状上的变化。同时,在糖分积累和工艺成熟期,采用IlluminaHiseq2000转录组学和TMT定量蛋白质组学对GXB9和B9进行了比较分析,以挖掘与蔗糖代谢和积累相关的基因和蛋白质,并检测了SSR分子多态性。 农艺和生理性状研究结果表明,在多个研究参数中,B9与GXB9之间均有差异。GXB9的发芽率和分蘖率低于B9。其他一些重要参数,如株高、叶长、叶宽、叶面积、节间数、节间长度、节间直径,B9均显著高于GXB9。同样,观测到GXB9和B9间在叶鞘颜色、叶鞘刺、蜡含量、+1叶颜色和形状、叶领毛、叶耳形状和颜色、节间颜色、髓、生长裂缝、芽形态和大小、芽沟及位置之间存在差异。 GXB9和B9间的植物激素含量也有差异。在生长旺盛期,GXB9的赤霉素含量显著高于B9。值得注意的是,在分蘖期,B9中的内源细胞分裂素含量显著高于GXB9。 GXB9和B9间的相对叶绿素含量SPAD和叶绿素a、b含量有一些差异,但不显著。光合作用分析表明,GXB9的净光合速率(Pn)、气孔导度(gs)、蒸腾速率(Tr)显著高于B9。 对纤维素合酶(CeS),细胞壁转化酶(CWIN),蔗糖合酶(SuSy)和蔗糖磷酸合 酶(SPS)等酶基因的qRT-PCR分析也表明GXB9和B9之间存在差异。相对表达量分析表明,与蔗糖代谢和积累有关的基因,如CeS、CWIN、SuSy和SPS在GXB9中上调表达,且其表达水平高于B9。GXB9的SuSy、CWIN、CeS基因在未成熟节间的表达水平高于成熟节间,而其成熟节间中SPS的表达水平高于未成熟节间。 甘蔗品质性状分析表明,GXB9的出汁率、蔗汁重力纯度、蔗汁锤度、蔗汁蔗糖分和甘蔗蔗糖分均高于B9。产量及其构成因素调查结果表明,GXB9的单茎重比B9低,但每公顷有效茎数比B9高,而GXB9的理论甘蔗产量却低于B9。 SSR分析结果表明,甘蔗基因型GXB9、B9和GT32之间存在遗传差异。 在蔗糖积累和成熟阶段对GXB9与B9进行了转录组分析。在蔗糖积累阶段的转录组分析共产生了112,170个unigene,并且有106,026(94.52%)个unigene能够在NR、GO、COG、KEGG、Swiss-Prot和Pfam公共数据库得到注释。在成熟阶段的转录组分析共获得了100,262个unigene,且有69,637个(69.46%)unigene在公共数据库得到注释。对unigene的功能注释分析表明,它们在多种代谢途径中均活跃存在。比较分析了B9和GXB9未成熟节间(int.5,6)和成熟节间(int.13,14)与蔗糖代谢和积累相关的重要差异表达unigene(DEG)的特性。蔗糖磷酸合酶(SPS;EC2.4.1.14),蔗糖合酶(SuSy;EC2.4.1.13)和转化酶(EC3.2.1.26)是重要的酶,在蔗糖的生物合成和蔗糖分解中起作用。蔗糖磷酸合酶(SPS1,SPS2,SPS4,SPS5)的DEGs表达在GXB9成熟节间显著上调表达,而在B9中则下调表达。SuSy和转化酶(CWIN,A/NINV)合成相关的DEGs主要在GXB9的未成熟节间上调表达,参与海藻糖合成的DEGs在GXB9的未成熟和成熟节间下调表达并在B9中上调表达。在GXB9成熟节间中SPS合成相关的DEPs上调表达而在B9中下调表达,这与GXB9突变体中较高的蔗糖积累有关。此外,GXB9中海藻糖合成相关的DEGs下调表达而在B9中上调表达可能是由于突变引起的。这也可能与GXB9中较高的蔗糖积累有关。 用TMT定量方法进行了GXB9与B9相比较的蛋白质组发现,总共鉴定出27,922种蛋白质。其中7,484(26.80%)个蛋白在COG、GO、Nr、Pfam和KEGG数据库中获得blast功能注释。与B9相比,在GXB9的未成熟节间(int.5,6)和成熟节间(int.13,14)中总共鉴定出3102种差异表达蛋白(DEP)。与B9相比,在GXB9成熟节间中,SPS蛋白(SPS2、SPS5)上调表达,而SuSy、CWIN、NIN1、CINV2蛋白下调表达。形态、生理、分子和农艺性状以及转录组学和蛋白质组学分析获得的数据表明,GXB9与B9存在显著差异,从而证实在GXB9基因型中发生了自发突变,使蔗茎中的蔗糖显著高于B9,并产生了形态、生理和农艺性状上的变化。因此,可以肯定地得出结论,GXB9是突变体,与B9相比具有更高的SPS表达水平,增强了其在茎中的蔗糖积累能力。

关键词

甘蔗/高糖突变体/生理分析/农艺性状/转录组分析/TMT蛋白质组学

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授予学位

博士

学科专业

作物栽培学与耕作学

导师

李杨瑞

学位年度

2021

学位授予单位

广西大学

语种

中文

中图分类号

S5
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