摘要
背景与目的 骨肉瘤是最常见的原发恶性骨肿瘤，在世界范围内对人类健康造成巨大威胁，尤其是在儿童和年轻人中。当骨肉瘤被诊断出来时，大约15-20%的患者存在转移，以肺转移多见，导致患者预后不良。而且骨肉瘤以手术治疗加联合化疗为主，截肢手术对患者的生存质量影响较大。本研究旨在找出骨肉瘤发病机制中的关键基因，探索骨肉瘤发病机制的上下游途径，寻找骨肉瘤治疗的新靶点，以期改善病人预后。 材料与方法 在GEO数据库下载4个骨肉瘤研究实验的数据集，并从中筛选差异表达基因(DEGs)，同时将4个数据集中共同存在的差异表达基因作为关键基因。采用基因集的富集分析(GSEA)找出与该关键基因相关的下游信号通路，并用和皮尔逊相关性分析验证信号通路与关键基因表达的相关性。为寻找其上游调控机制，使用皮尔逊相关性分析研究了关键基因与DNA甲基化位点之间的表达相关性。 实验结果 TFF3是唯一在GEO数据库4个骨肉瘤数据集中同时存在的差异表达基因，并且在骨肉瘤中是低表达。TFF3低表达与骨肉瘤患者预后不良相关，差异具有统计学意义(P＜0.05)。对TFF3潜在下游通路进行研究，基因集富集分析揭示了TFF3与细胞因子-细胞因子受体相互作用途径、移植物抗宿主病途径、原发免疫缺陷途径及I型糖尿病途径等通路密切相关，相关性分析表明TFF3在骨肉瘤中与细胞因子-细胞因子受体相互作用途径呈正相关，表明TFF3在骨肉瘤中通过该途径发挥调控作用。本研究还显示骨肉瘤组织和正常骨组织中TFF3基因甲基化状态无统计学差异，相关性分析表明，在骨肉瘤样本中TFF3与其DNA甲基化位点无相关性，提示TFF3在骨肉瘤中低表达不是DNA甲基化调控的结果。 结论 TFF3是骨肉瘤的关键基因并在骨肉瘤中低表达，TFF3低表达与骨肉瘤患者预后不良相关。TFF3在骨肉瘤中的低表达不受DNA甲基化沉默所调节。TFF3通过细胞因子-细胞因子受体相互作用途径促进骨肉瘤的发生发展，TFF3在骨肉瘤中的具体作用机制及对化疗敏感性的影响有待进一步研究。
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