摘要
目的: 肺腺癌(LUAD)是常见的恶性肿瘤,免疫浸润细胞在LUAD的发生发展中起着关键作用。趋化因子可以调节肿瘤免疫细胞,从而影响LUAD患者的治疗效果和预后。本研究旨在筛选与免疫浸润相关的趋化因子作为LUAD患者预后的生物标志物。 方法: 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载LUAD患者的转录组表达谱及临床信息。用CIBERSORT算法计算22个免疫细胞的相对分数。利用肿瘤免疫数据库(TumorImmuneEstimationResource,TIMER)和肿瘤免疫相互作用数据库TISIDB(Tumor-ImmuneSystemInteractionsDatabase,TISIDB)研究LUAD中差异表达的趋化因子与肿瘤浸润性免疫细胞的相关性。利用ClusterProfilerR软件包对这些趋化因子进行功能富集分析。另外,利用互作基因检索(SearchToolfortheRetrievalofInteractingGene,STRING)数据库检索工具构建了蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络,筛选关键基因(hubgene)。最后,对hub基因进行生存分析(Kaplan-Meie分析方法)对患者的总生存期(OS)进行统计分析,评价hub基因在LUAD发生发展中的预后价值。 结果: 1.LUAD组织中,T细胞亚群占主导地位,其中CD4+T细胞含量最高,其次是CD8+T细胞亚群、调节性T细胞;巨噬细胞和单核细胞分布较多,并且M2型巨噬细胞较多。CD4+激活记忆T细胞、幼稚B细胞、浆细胞、滤泡辅助T细胞、调节T细胞均低于正常组,静息NK细胞、单核细胞、M2型巨噬细胞、静息状态的肥大细胞等在肿瘤组织中升高。 2.22个趋化因子在LUAD组织中差异表达,与肿瘤浸润性免疫细胞相关。功能富集分析表明,这些趋化因子主要是通过趋化因子应答、细胞因子活性和趋化因子信号通路富集。筛选CXCL9和CXCL10为hub基因,CXCL9和CXCL10的表达与LUAD患者的生存时间相关。 结论: 肿瘤浸润免疫细胞相关的趋化因子CXCL9和CXCL10可能作为LUAD的预后标志物。