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基于网络药理学探究广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的作用机制

任雪童

基于网络药理学探究广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的作用机制

任雪童1
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作者信息

  • 1. 河北中医学院
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摘要

目的:运用网络药理学技术预测广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的作用靶点和通路机制,并通过分子对接技术进行验证。 方法:通过中药系统药理学数据库平台检索广藿香-佩兰的所有化学成分,筛选出符合标准的化合物及其对应靶点,然后借助Uniprot数据库将所得靶点转换成对应的靶点基因。通过GeneCards数据库、OMIM数据库获取幽门螺旋杆菌相关性胃炎的疾病靶点。利用Cytoscape软件构建广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的“药物-靶点-疾病”网络。通过String数据库获取广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的蛋白相互作用网络数据,并通过Cytoscape软件构建靶点网络拓扑图。利用R软件对潜在靶点数据结果进行GO功能、KEGG通路的富集分析。最终利用Autodock等软件进行分子对接对结果进行模拟验证。 结果: 1.广藿香-佩兰的活性成分和作用靶点:共筛选到满足条件的活性成分15种。广藿香含有8种有效活性成分,佩兰含有7种有效活性成分。 共收集到预测靶点181个,广藿香活性成分的作用靶点有157个,佩兰活性成分的作用靶点有79个。 2.幽门螺旋杆菌相关性胃炎的疾病靶点以及疾病与药物的交集靶点:共筛选到幽门螺旋杆菌相关性胃炎的疾病靶点949个。疾病与药物的交集靶点共有87个。 3.广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的“药物-靶点-疾病”网络:基于Cytoscape构建广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的“药物-靶点-疾病”网络,网络共含有103个节点和160条边。 4.靶点蛋白拓扑网络:通过String数据库获取广藿香-佩兰治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的蛋白相互作用网络数据,并通过Cytoscape软件构建靶点网络拓扑图。最终拓扑出核心靶点15个:TP53、EGF、PTGS2、MAPK14、MYC、CCND1、VEGFA、CASP3、CXCL8、MAPK1、AKT1、FOS、EGFR、MMP9、JUN。 5.富集分析结果:GO生物学富集分析结果显示,共富集到2288个条目,其中包括2101个生物过程,45个细胞组分,141个分子功能。生物过程主要涉及:氧化应激反应、对细菌源分子的反应、凋亡信号通路的正负调控等。细胞组分主要富集在:细胞囊泡、膜筏等位置。分子功能主要涉及:蛋白酶结合、细胞因子受体结合、磷酸酶绑定、激酶调节活动等。KEGG通路富集分析结果显示,共富集到151条信号通路,主要涉及PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE糖尿病并发症、疱疹病毒感染、人类巨细胞病毒感染、白介素-17等信号通路。 6.分子对接模拟验证结果:分子对接结果显示,5个活性成分与15个靶点部分或全部对接成功。 结论: 1.广藿香-佩兰是在多种有效活性成分的共同作用下发挥治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的作用的,其中槲皮素、毛地黄黄酮、尼泊尔鸢尾素可能为重要成分。 2.广藿香-佩兰可能通过作用于TP53、EGF、PTGS2、MAPK14、MYC、CCND1、VEGFA、CASP3、CXCL8、MAPK1、AKT1、FOS、EGFR、MMP9、JUN等基因发挥治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的作用。 3.广藿香-佩兰可能通过调节氧化应激反应、对细菌源分子的反应、凋亡信号通路的正负调控、蛋白酶结合、细胞因子受体结合、磷酸酶绑定和激酶调节活动等生物过程或分子功能发挥治疗幽门螺旋杆菌相关性胃炎的作用,涉及的信号通路包括PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE糖尿病并发症、疱疹病毒感染、人类巨细胞病毒感染、白介素-17等通路。

关键词

幽门螺旋杆菌相关性胃炎/广藿香-佩兰/网络药理学/分子对接

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授予学位

硕士

学科专业

中医内科学

导师

杜艳茹

学位年度

2021

学位授予单位

河北中医学院

语种

中文

中图分类号

R2
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