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番茄miR394抗晚疫病机制研究

张媛媛

番茄miR394抗晚疫病机制研究

张媛媛1
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作者信息

  • 1. 大连理工大学
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摘要

番茄(Solanumlycopersicum)易受多种病原菌的侵害,是研究植物患病机理的理想物种。晚疫病是番茄的一种毁灭性病害,发病时会造成严重减产。常规的防治方法存在极大局限性,因此利用基因工程手段发掘有利基因,培育抗病品种尤为重要。基因组上的非编码RNA(Non-codingRNA,ncRNA)在植物对生物胁迫的响应中起着关键作用,它包括微小RNA(MicroRNA,miRNA)、长非编码RNA(Longnon-codingRNA,lncRNA)、小干扰RNA(SmallinterferingRNA,siRNA)等多种类型。miR394属于miRNA家族成员之一,其表达水平在病原菌侵染后会发生显著变化。实验室前期预测了miR394的内源竞争性RNA(CompetingendogenousRNA,ceRNA):lncRNA40787,lncRNA27177和lncRNA42566。根据晚疫病菌侵染后的表达特性,最终挑选了lncRNA40787进行下一步研究。随后分别过表达和沉默了miR394及lncRNA40787,阐明了miR394与lncRNA40787在番茄抗晚疫病中的作用机制及功能。 首先,为探究miR394在番茄抗晚疫病中起到的作用,本研究通过与植物高效表达载体连接以及短串联靶标模拟技术(Shorttandemtargetmimic,STTM)构建了miR394的过表达及沉默载体。利用瞬时侵染将两种重组载体转入番茄,发现miR394的过表达会降低其靶基因LCR(LeafCurlingResponsiveness,LCR)的转录水平,影响茉莉酸(Jasmonicacid,JA)信号通路的关键基因表达,最终降低番茄对晚疫病感染的抵抗力;沉默后结果则与之相反。证明了miR394的负调控作用。 其次,在获得了miR394相关的三个lncRNAs(lncRNA40787,lncRNA27177和lncRNA42566)的序列后,分析了这三个lncRNAs上存在的内源靶标模拟(Endogenoustargetmimicry,eTM)位点。接种晚疫病菌后对miR394、三个lncRNAs、LCR的表达特性进行分析,发现三个lncRNAs均呈现出明显的上升趋势,miR394被显著抑制,LCR表达模式则与lncRNA40787大致相同。以上结果证明三者确实会对该胁迫做出响应。进一步研究发现,在番茄植株瞬时过表达lncRNA40787后,miR394表达水平显著下降,LCR基因的表达量则明显上升,番茄对晚疫病的抗性得到了提高。该结果初步证明miR394可被lncRNA40787吸附,进而调控靶基因的转录水平,影响番茄对晚疫病的抗性。 最后,构建了lncRNA40787的沉默及突变载体。沉默lncRNA40787后,miR394的表达量显著升高,LCR的表达水平下降。接种晚疫病菌后,番茄叶片的病斑面积和病斑直径明显变大,植株抗病能力降低。为进一步说明lncRNA40787与miR394二者间的直接作用关系,瞬时转入了lncRNA40787突变体载体pBI121-mlncRNA40787,发现miR394在pBI121-mlncRNA40787转化叶片中表达量并无显著差异变化。综合以上结果,我们可以得出结论:miR394的确可以被lncRNA40787吸附。 综上所述,本研究验证了lncRNA40787是miR394的ceRNA,明确了miR394在番茄感染晚疫病后的负调控作用。我们的研究提出了lncRNA40787-miR394-LCR调控网络,为揭示番茄抗晚疫病的分子机制提供了理论基础和参考。

关键词

番茄/MiR394/LncRNA/晚疫病/CeRNA

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授予学位

硕士

学科专业

生物学

导师

栾雨时

学位年度

2021

学位授予单位

大连理工大学

语种

中文

中图分类号

S6
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