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披碱草属种质资源表型性状与基于RAD-seq测序的遗传多样性分析

尹婷婷

披碱草属种质资源表型性状与基于RAD-seq测序的遗传多样性分析

尹婷婷1
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作者信息

  • 1. 新疆农业大学
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摘要

本研究以来源于新疆、青海、西藏三省的90份披碱草属(Elymus)种质为试验材料,对其两年的表型性状进行观测,并运用RAD测序(Restriction-siteAssociatedDNA-sequencing,RAD-seq)对其中的48份材料进行遗传多样性分析,以期了解不同地区披碱草属植物的遗传多样性特点,分析披碱草属种质资源间的亲缘关系,揭示供试材料间遗传差异和变异规律,筛选性状优良的单株。通过对各性状的变异性、多样性、相关性及聚类进行分析,探索表型性状多样性及表型变异的规律,其次,基于RAD测序技术对披碱草属种质资源的遗传多样性进行研究,结果如下:(1)披碱草属植物表型变异和多样性较丰富,群体内的平均变异系数小于群体间,变异多来自群体间,5种披碱草属植物各性状的变异程度依次是叶部>穗柄部>小穗部。(2)气候因素对老芒麦生长过程有一定影响,且主要影响叶部长度、穗柄长、穗轴第一节间长和外稃长等伸长生长指标,这些指标与经度呈极显著正相关(P<0.001)、与纬度呈极显著负相关(P<0.001);叶片大小与日照辐射量成正比、与降水量成反比,茎秆长度与日照辐射量成反比、与降水量成正比;垂穗披碱草(Elymusmuans)、青海披碱草(Elymusgeminata)、麦薲草(Elymustangutorum)和披碱草(Elymusdahuricus)的表型性状指标与采样地的气候因子无明显相关关系。(3)通过聚类与隶属函数分析从老芒麦中筛选出14份具有优良性状的种质材料,其中6份种质材料穗部性状优良,3份种质材料茎秆较粗、株高适中,5份种质材料叶层高度较低,叶量较多。植株高大、叶片宽大、茎秆较粗的材料从青海披碱草中筛选出2份、垂穗披碱草中筛选出2份、麦黄草中筛选出1份、披碱草中筛选出1份。穗部性状指标优良、种子产量较高的材料,从青海披碱草中筛选出2份、垂穗披碱草中筛选出2份、麦薲草中筛选出1份、披碱草中筛选出1份。(4)RAD-seq测序得到631.05G原始SNP位点和610.26G质量高的SNPs位点,可用于群体遗传多样性分析。种内的遗传多样性大,遗传变异丰富。(5)系统进化树、PCA分析和遗传结构图结论一致:披碱草、麦黄草、肥披碱草三者之间的亲缘关系较近,聚为一个支系,老芒麦与垂穗披碱草之间亲缘关系较近,聚为一个支系。群体选择消除分析显示,越是形态相近的种之间,亲缘关系越近,群体间的遗传分化系数越小。(6)在48份种质材料中,两年间表型聚类结果与RAD测序结果划分一致的材料约占50%,可见表型分类结果和分子测序结果两者相互印证、较好地契合。研究结果为披碱草属牧草新品种选育提供优质材料和理论依据。

关键词

披碱草属/种质资源/RAD测序/表型多样性/遗传多样性

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授予学位

硕士

学科专业

草学

导师

谷丽丽

学位年度

2021

学位授予单位

新疆农业大学

语种

中文

中图分类号

S6
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