摘要
蜱虫作为仅次于蚊子的第二大虫媒病毒传播媒介,可携带160余种病毒,其中20%-30%对人类或家畜具有致病性。为了探究我国新疆和内蒙古地区蜱虫携带病毒的本底情况,调查是否存在人兽共患相关疾病的病毒或有潜在致病性的病毒,本研究对新疆地区4个地区(青河、富蕴、福海及乌苏)和内蒙古的4个地区(四子王旗,阿拉善左旗、右旗和左右旗交界处)的家畜体表寄生蜱进行采集,利用宏转录组学及生物信息学等相关技术对采集的蜱虫进行病毒组学与分子流行病学进行了研究。通过实验,获得了如下结果: 1.在新疆地区共采集到了2个属6种蜱虫,包括亚洲璃眼蜱(Hyalommaasiaticum),森林革蜱(Dermacentorsilvarum),草原革蜱(Dermacentornuttalli),盾糙璃眼蜱(Hyalommascupense),边缘革蜱(Dermacentormarginatus)以及嗜驼璃眼蜱(Hyalommadromedarii),共1,328只蜱虫;在内蒙古共采集了除盾糙璃眼蜱外与新疆类似的2个属5种共1,308只蜱虫。 2.在新疆和内蒙古的8个蜱虫宏转录组中共获得了718,115条病毒reads,其结果注释为17个已知的病毒科和布尼亚病毒目(Bunyavirales)的病毒,其包括了双链RNA(dsRNA)病毒,ssRNA(-)和ssRNA(+)病毒。病毒的天然宿主包括哺乳动物在内的脊椎动物、节肢动物、植物、细菌以及真菌。Alpha和Beta多样性分析显示,新疆和内蒙古两组间在病毒丰富度上并没有差异,在病毒的多样性上虽有一定差异但不具有统计学意义。但是内蒙古里的四子王旗组在多样性和病毒种类组成上与另7组相比具有较大的差异。 3.在8个蜱虫转录组文库中共获得了7个已知的病毒科和一些未分类的病毒里的21种病毒,包括了9种已鉴定的病毒,12种新病毒。系统发育树显示大部分RNA病毒聚集在已知的病毒科属内,而部分病毒表现出独特的进化历程。在阿拉善地区的蜱虫中鉴定出一种新的白蛉病毒——阿拉善蜱白蛉病毒,该病毒在进化关系上与日本的Makuwuvirus关系最紧密,在进化起源上与白蛉病毒的祖先更接近。在内蒙古的四子王旗首次发现了发热伴血小扳减少综合征病毒(Severefeverwiththrombocytopeniasyndromevirus,SFTSV)的存在。通过系统进化树来看,该毒株的L与M片段与目前所发现的毒株均未聚集到一起,而S片段与日本的B型聚在一个进化分支上。 4.在内蒙古蜱虫宏基因组共得到了3,568,561条reads,其中病毒reads有12,931条,占0.36%。被注释为病毒的序列属于20个已知的病毒科和未分类的病毒信息,包括dsDNA病毒,ssDNA病毒以及单链RNA(ssRNA)病毒。该病毒的天然宿主分类包括脊椎动物、节肢动物、植物及噬菌体。通过反向半套式PCR在内蒙古蜱虫扩增得到了一条全长2,042nt的圆环病毒,并利用系统进化和同源比较分析发现该病毒是一株鸽圆环病毒。 以上这些研究表现出这些地区蜱媒病毒的组成分布与多样性情况,阐明了蜱媒病毒在病毒进化过程中的演化历程,并揭示了部分蜱媒病毒可能存在跨区域、跨物种传播,这些研究为中国新疆和内蒙古地区蜱虫携带病毒本底情况,以及防控新发病毒的流行和扩散提供了重要的基础数据。