首页|Wnt基因家族在三种双壳贝类中的鉴定及表达分析

Wnt基因家族在三种双壳贝类中的鉴定及表达分析

刘思诺

Wnt基因家族在三种双壳贝类中的鉴定及表达分析

刘思诺1
扫码查看

作者信息

  • 1. 中国海洋大学
  • 折叠

摘要

Wnt信号通路作为调控动物机体的五大信号通路之一,参与了胚胎早期器官发育形成,干细胞调控和免疫调节等多种重要生命过程。Wnt基因家族成员在各物种间具有高度保守的序列区域,功能上也有一定的相似性,其在人,鼠等脊椎动物中的结构和功能被广泛研究,而在无脊椎动物中研究相对较少。软体动物双壳类作为一种古老的生物类群,对其开展Wnt基因家族的系统性研究有助于全面了解Wnt基因家族的起源进化及其家族成员在无脊椎动物胚胎发育,免疫调节等方面的功能。 本研究对虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis),栉孔扇贝(Chlamysfarreri)和长牡蛎(Crassostreagigas)三种双壳贝类的Wnt基因家族进行了全基因组筛查,分别鉴定出了12,11,13个Wnt基因。其中,栉孔Wnt8基因cDNA序列最长,可编码777个氨基酸,牡蛎Wnt9acDNA序列最短,编码166个氨基酸。从基因组结构来看,扇贝Wnt家族成员基因结构类似,内含子大多为3-5个,牡蛎Wnt基因内含子数目差异较大,例如,Wnt9a没有内含子,而Wnt16则含有8个内含子。通过与其他16种分化节点动物(包括1个刺胞动物,3个后口动物,3个蜕皮动物和9个冠轮动物)进行蛋白多序列比对并构建系统发生树,发现Wnt基因家族共13个亚族,包括Wnt1-11,Wnt16,WntA。其中,虾夷扇贝,栉孔扇贝,长牡蛎的Wnt基因被分为12,11,12个亚族。三种双壳贝类都缺少Wnt3亚族,而栉孔扇贝同时还缺少Wnt9亚族,此外,长牡蛎Wnt9亚族发现两个拷贝,可能存在进化复制现象。同一物种中Wnt家族各成员间序列相似度较低,但与其他物种如鱼、爪蟾和鼠的直系同源基因间序列相似度高,基因高度保守。同时,研究发现Wnt基因的连锁现象在各物种中广泛存在,三种双壳贝类间Wnt的连锁基因簇互不相同,通过与其他物种的对比分析,为进行Wnt基因的亲缘关系鉴定以及探究家族进化过程中的复制事件提供参考。 利用转录组数据,本研究对三种双壳贝类Wnt基因在各组织和各胚胎时期的时空表达模式进行分析,结果表明Wnt基因可能参与调控双壳贝类的多种生命现象,例如壳的形成,性别调控和胚胎的早期发育等。在三种贝类的胚胎幼虫发育过程中,Wnt亚家族成员表达具备明显的变化规律。其中,Wnt8,Wnt10,amp;nbsp;Wnt11在牡蛎的卵裂阶段持续表达,表明其可能与细胞增殖分化有关;在扇贝中,WntA,Wnt11,Wnt16则可能参与胚层的形成和形态发生;Wnt7,Wnt8,Wnt10则可能与初生壳的形成有关。通过综合分析三种贝类Wnt基因的组织表达模式,发现与牡蛎相比,Wnt基因在虾夷扇贝和栉孔扇贝中的组织表达模式更为相近。其中,多个Wnt基因在扇贝的外套膜和鳃中同时高表达,可能参与了成体壳的形成等;而牡蛎中Wnt基因则多在性腺高表达,推测Wnt基因家族可能与牡蛎的性别决定和分化相关。牡蛎生活在高度压力的潮间带海洋环境中,为进一步探究Wnt基因是否参与调控双壳贝类的适应性,本研究分析了在温度,盐度,干旱三种胁迫条件下牡蛎Wnt基因的应答模式。结果表明,温度和干燥胁迫条件下,Wnt1,Wnt2,Wnt4,Wnt5,Wnt6,Wnt7,Wnt9b多个基因的表达显著变化;在盐度胁迫条件下,Wnt基因表达变化相对较小,主要为Wnt1,Wnt16和Wnt9b。 本次研究系统的描述了双壳类Wnt基因的特征,这将有助于更好地理解原口动物Wnt基因家族的进化和功能。

关键词

双壳贝类/Wnt基因家族/基因鉴定/基因表达

引用本文复制引用

授予学位

硕士

学科专业

海洋生物学

导师

王师

学位年度

2019

学位授予单位

中国海洋大学

语种

中文

中图分类号

Q95
段落导航相关论文