摘要
脊尾白虾（Exopalaemoncarinicauda）是我国重要的海水养殖经济物种，具有环境适应性强、食性杂、生长速度快等优点。脊尾白虾生长性状显现性别二态性，雌性成熟个体平均体重大于雄性，在实际生产中如能建立有效的性别操控技术，将显著提高养殖效益。因此，脊尾白虾的性别决定机制及性别连锁分子标记发掘的研究具有重要意义，可为性别操控技术的开发提供理论基础。本研究利用简化基因组测序技术(SLAF-seq)构建了脊尾白虾高密度遗传连锁图谱，并首次将性别QTL特异定位于LG3连锁群0-132.765cM区间;继而，结合GWAS分析方法，进一步筛选性别连锁候选分子标记，并在群体水平进行验证，研究结果如下: 1.脊尾白虾高密度遗传连锁图构建及性别QTL定位 利用脊尾白虾100尾子代及其亲本进行SLAF测序，获得240Mreads(48.6Gb)数据，开发得到757,920个SNP，其中可用于分型的SNP为124，662个。将上述标签依照测序深度过滤获得12，490个高质量标签用于做图，采用HighMap软件进行连锁分析，共构建45个连锁群，上图9，280个Marker，总图距为5，666.72cM，上图标记完整度为99.88％。基于高密度遗传连锁图谱，通过mapQTL6.0软件将性别QTL特异定位于LG3连锁群的0-132.765cM区间（LOD阈值为5.47），其中LOD＞50的标记共186个。 2.脊尾白虾性别连锁SNP标记的筛选及验证 基于QTL定位结果，结合GWAS分析(P＜10-40)，从QTL区间中共筛选到52个性别相关候选标记，其中nnxnp类型的标记占96.2％，表明脊尾白虾性别决定类型可能为ZZ/ZW型。将候选标记在群体中进行与性别的关联分析（雌雄个体各30个），获得7个与性别紧密连锁的SNP及INDEL标记，大多数标记类型(6/7)倾向于雌性杂合且雄性纯合。其中与性别连锁最紧密的标记为M57734，该标记为G/A突变型SNP，其在雌性中的杂合占比96.3％，雄性纯合占比84.6％(P＜0.001)，支持脊尾白虾为ZZ/ZW型性别决定物种。
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