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腹泻相关病毒多重real-time PCR检测方法的建立

毛彤瑶

腹泻相关病毒多重real-time PCR检测方法的建立

毛彤瑶1
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作者信息

  • 1. 华北理工大学
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摘要

目的:构建17种腹泻相关病毒的重组质粒并制备相应的DNA或RNA标准品,建立可同时筛查17种腹泻病毒的多重Real-timePCR组合检测技术,实现腹泻突发疫情中腹泻相关病毒的快速检测。 方法:1.应用PrimerExpress3.0生物学软件设计和评估17种腹泻相关病毒的引物及探针。2.基于基因克隆技术原理制备重组质粒,采用PCR获得病毒目的片段并与T-easy载体连接,再转化导入宿主细胞复制扩增重组质粒。3.通过PCR或体外转录制备17种腹泻相关病毒的DNA或RNA标准品。4.分别优化17种病毒的单重/多重Real-timePCR方法的反应体系和反应条件,评价所建立方法的灵敏性(最低检出限)、特异性(交叉反应)和稳定性(组内、组间重复)。5.收集2020年9~11月重庆某医院5岁以下儿童粪便腹泻样本对所建立的方法进行应用评价。 结果:1.成功获得了作为实验室评价参考品的17种病毒的重组质粒和标准品。2.17种病毒单重检测的最低检出限可达到100~103copies/μL,组间无明显交叉反应,批内变异系数小于3%,批间变异系数小于4%。3.建立了同时检测17种腹泻病毒的6组多重实时荧光定量PCR方法,最低检出限可达到100~103copies/μL,与单重反应相比无明显差异,组内组间无明显交叉反应,批内、批间变异系数均小于5%。4.利用上述方法对2020年重庆某医院100例儿童腹泻样本进行了检测,79例患儿样本检测阳性,包括5例诺如病毒GI型、52例诺如病毒GII型,6例肠道腺病毒,14例星状病毒,6例札如病毒,5例A组轮状病毒,1例诺如病毒GIV型,其中7例混合阳性。 结论:成功构建17种腹泻相关病毒的重组质粒并制备相应的DNA或RNA标准品。本研究建立的17种腹泻相关病毒的单重和多重Real-timePCR检测方法的灵敏度高、特异性强和稳定性好,可以在实验室推广应用。本研究为腹泻多病原的快速检测提供了技术储备,也为进一步建立能实现更多病原更少组合的检测方法奠定了基础。

关键词

腹泻相关病毒/重组质粒/基因克隆/PCR检测

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授予学位

硕士

学科专业

病原生物学

导师

裴银辉/李丹地

学位年度

2021

学位授予单位

华北理工大学

语种

中文

中图分类号

R3
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