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新型鹅细小病毒鸭胚传代毒全基因组序列分析及其感染性克隆的构建

郝雪飘

新型鹅细小病毒鸭胚传代毒全基因组序列分析及其感染性克隆的构建

郝雪飘1
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作者信息

  • 1. 河北农业大学
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摘要

自2014年以来,我国江苏、山东、河北等地商品肉鸭群出现了以雏鸭发育迟缓,上下喙萎缩,舌头外伸、肿胀、向下弯曲为主要特征的疾病,俗称为“鸭短喙与侏儒综合征”(Shortbeakanddwarfismsyndrome,SBDS),给我国养鸭业造成了巨大经济损失。该病的病原为新型鹅细小病毒(Novelgooseparvovirus,NGPV),也称为鸭源鹅细小病毒、新型鸭细小病毒等。目前,决定NGPV毒力的关键基因和NGPV跨种传播的原因尚不明确。 为获得一株NGPV减毒毒株,本研究将NGPVSD株在鸭胚上连续传至F50代,将F5代尿囊液与F50代尿囊液分别感染3日龄樱桃谷鸭进行致病性试验,观察感染后鸭的体重、喙长与排毒情况。与对照组相比,F5感染组体重在14dpi时呈极显著差异,喙长在7dpi时呈显著差异,14dpi时呈极显著差异,在3dpi时10只雏鸭均出现排毒;而F50感染组体重在14dpi时呈显著差异,21dpi时呈极显著差异,喙长在7dpi时呈显著差异,14dpi时呈极显著差异,在5dpi时10只雏鸭均出现排毒;综上所述,与F5代相比,F50代毒力明显减弱。 为探究影响NGPV毒力的基因位点,本研究对SD株F10、F20、F30、F40和F50进行了全基因组测序,经序列比对发现SD-F50突变的碱基位点涵盖了之前所有代次中突变的位点,将SD-F50与SD株进行碱基序列对比,发现在ITR区域中发生G26A、C61T、G320A、C355T突变,并于72、309位分别插入了碱基A和碱基T;在NS基F50与SD株的NS蛋白与VP蛋白氨基酸序列进行比较,在NS基因中,SD-F50相比较于SD株的突变为N225T,在VP基因,SD-F50相比较于SD株的突变为T465A、N703K;以上位点的改变或许会影响NGPV的毒力。 为进一步探究这些突变位点与致病力之间的关系,本研究构建了SD株的全长感染性克隆质粒。通过同义突变在基因组3807位引入遗传分子标记,消除NcoⅠ酶切位点,可后续用于区分拯救病毒与亲本病毒。将重组质粒同时转染鸭胚尿囊腔与卵黄囊途径拯救病毒,然后对其进行鉴定,将其命名为rSD。 本研究通过对NGPVSD株传代株进行全基因组序列分析,发现SD株基因组序列在鸭胚传代过程中发生了一些适应性突变,这些突变或许与NGPV的致病性和NGPV对鸭的适应性有关,为NGPV毒力的关键基因的研究提供了参考依据。同时NGPVSD株感染性克隆的成功构建也可为NGPV毒力因素与跨种传播研究提供技术支持。

关键词

新型鹅细小病毒/毒力基因/全基因组分析/跨种传播

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授予学位

硕士

学科专业

预防兽医学

导师

袁万哲;赵款

学位年度

2021

学位授予单位

河北农业大学

语种

中文

中图分类号

S8
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