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胆汁酸钠同向转运蛋白家族基因全基因组鉴定及其参与非生物胁迫应答功能研究

MYO THWIN

胆汁酸钠同向转运蛋白家族基因全基因组鉴定及其参与非生物胁迫应答功能研究

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  • 1. 郑州大学
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摘要

盐胁迫是限制棉花(Gossypium spp.)生产的主要非生物胁迫之一。确定棉花中参与Na+吸收和分配相关的转运蛋白将有助于解析棉花盐胁迫应答机制。胆汁酸:钠共转运蛋白(BASS)家族蛋白是一类编码钠依赖底物溶质共转运的跨膜蛋白。尽管已对哺乳动物中BASS转运体的钠转运特性进行了充分的研究,但BASS蛋白在植物中的钠转运能力及其在植物耐盐性中的功能仍然未知。 在本研究中,首先鉴定了来自4个棉种以及30个其他物种的BASS家族成员。然后,根据它们的序列相似性和系统发育关系将它们分为BASS1至BASS5五个亚家族。进化研究表明,所有的BASS家族基因均源自祖先的BASS4基因。除了3个C4单子叶植物中未发现BASS3基因外,本研究选择的所有被子植物都包含了所有5个BASS亚家族成员。在四个棉种,雷蒙德氏棉,木棉,陆地棉和海岛棉中,分别鉴定到11,8,16和18个BASS基因。虽然全基因组复制(WGD)和染色体片段重复促使棉花的BASS基因家族得以扩展,但从二倍体向异源四倍体的进化过程中,丢失了多个BASS基因。在本研究的四个棉种基因组中,BASS直系同源基因保留了非常保守的染色体定位、基因结构和功能结构域,特别是保守的十个跨膜片段和两个保守的Na+结合位点。研究陆地棉BASS家族基因的转录表达谱表明,它们不仅具有组织表达特异性,而且还受到各种胁迫和植物激素的差异诱导。此外,研究陆地棉BASS基因在植物耐盐胁迫应答过程中的功能发现,GhBASS1和GhBASS3正调控植物耐盐性,而GhBASS2、GhBASS4和GhBASS5负调控植物耐盐性。综上所述,BASS基因在原核与真核生物分化之前就已经进化出了5个亚家族,因此推测它们在所有生物中的功能都非常保守。而陆地棉GhBASS作为一类定位于质体膜的钠依赖转运蛋白,影响了棉花的耐盐性。 接下来,深入研究了GhBASS5基因的Na转运相关功能。结果表明GhBASS5在棉根中高度表达,主要存在于维管束中。在拟南芥原生质体细胞中异源表达GhBASS5促进了细胞对Na+的吸收,从而增加了细胞质在的Na+的浓度。在过表达GhBASS5转基因拟南芥中,根组织的Na+外排速率显著下降,而从根到地上部的Na+转运速率增加,显著提高了地上部的Na+积累,K+/Na+比率降低,特别是在盐胁迫条件下。此外,与盐胁迫下的野生型植物相比,过表达的GhBASS5在转基因拟南芥中质体的功能收到破坏,植物对盐胁迫更加敏感。此外,调节K+/Na+稳态的盐响应转运蛋白基因在过表达GhBASS5植株中显著上调表达。综上所述,这些结果表明GhBASS5是一个质体定位的Na+转运蛋白,GhBASS5的高水平表达会增加植物的Na+吸收和转运,影响植物的耐盐性。 继续研究了GhBASS5在植物抗干旱胁迫的响应机制中的作用。已知AtBASS5是GLS生物合成通路的关键基因,芥子油苷(GSLs)被报道参与植物的气孔调控及干旱应答,并有证据显示Na+会促进拟南芥中GLS的合成。然而,没人能够清楚地解释GLS与Na+以及植物耐旱性之间的关系。在本研究在,证明了BASS5通过Na+依赖的方式将酮酸导入质体,参与脂肪GLS的合成。脂肪族GLS会诱导气孔关闭,以减轻胁迫植物的干旱敏感性,以及提供适度的Na+处理和过表达GhBASS5都能提高GLS的水平,进而提高植物的耐旱性。BASS5参与了植物从根到地上部的长距离Na+转运,将干旱富集的Na+转换为了植物内源GLS信号。本研究通过研究BASS5参与了Na+的运输,阐明了GLS合成在植物抗旱性的作用。

关键词

棉花/BASS家族基因/全基因组鉴定/非生物胁迫/应答机制

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授予学位

博士

学科专业

生物信息学

导师

田保明;师恭曜

学位年度

2021

学位授予单位

郑州大学

语种

中文

中图分类号

S5
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