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钝齿棒杆菌鸟氨酸氨甲酰基转移酶的表达、纯化及特性研究

朱凌峰

钝齿棒杆菌鸟氨酸氨甲酰基转移酶的表达、纯化及特性研究

朱凌峰1
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作者信息

  • 1. 江西师范大学
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摘要

鸟氨酸氨甲酰基转移酶(ornithine transcarbamylase,OTC;EC2.1.3.3)是一种以氨基甲酰磷酸、L-鸟氨酸为底物,催化氨甲酰基团转移至鸟氨酸生成L-瓜氨酸的蛋白酶。该酶广泛存在于动物、植物及微生物中,是新陈代谢不可或缺的酶,因此研究鸟氨酸氨甲酰基转移酶的结构、功能以及催化特性具有十分重要的意义。本研究以钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum MT)基因组为模板,克隆C.crenatum OTC的编码基因argF的开放阅读框,构建基因表达载体转化至大肠杆菌BL21(DE3)以表达重组蛋白,并通过亲和层析进行纯化;在此基础上分析了C.crenatum OTC的基本酶学性质并通过生物信息学以及定点突变对酶的活性中心、功能结构进行了研究。本实验的主要研究结果如下: 1.C.crenatum OTC编码基因argF的克隆、诱导表达及鉴定:通过PCR技术克隆argF开放阅读框,并连接至表达载体pXMJ19,转化至BL21进行表达,结果表明37℃,经0.7mM IPTG诱导培养8小时可获得最高表达量的具有生物活性的可溶性蛋白;SDS-PAGE分析发现,获得的重组蛋白分子量约为37kDa。 2.C.crenatum OTC的酶学性质:酶活性测定实验表明,C.crenatum OTC的酶促反应最适pH为9.0左右,最适温度在35℃左右,Cu2+对该酶活力有抑制效应;动力学参数Kmcp为4.71mM、Kmorn为0.28mM、Kcat为4.13S-1、Vmax为7.21μmol?min-1?mg-1。 3.C.crenatum OTC关键氨基酸残基的鉴定:通过SWISS-MODEL预测OTC蛋白酶的活性中心,对处于该活性中心的氨基酸进行突变,构建丙氨酸扫描文库,鉴定出了对酶活性起重要作用的氨基酸残基位点:R57A、N171A、D234A、L275A和R302A,这些氨基酸残基的突变导致酶的比活力降低90%及以上。对酶活力回复突变体分析发现,这几个氨基酸残基位点维系着酶活性中心与底物之间的氢键作用力,并对酶活性中心的电荷环境有着一定的影响。其次,确定了两个处于酶活性中心入口处的氨基酸残基位点Pro276和Tyr278,P276维持着酶活性中心的疏水性环境,它的突变会导致酶的比活力下降90%;Y278突变为丙氨酸则可以扩大底物进出酶活性中心的路径,使得酶的比活力上升8.5%。同时,本研究找到了在其它物种OTC中保守的氨基酸残基位点,但在钝齿棒杆菌OTC中不保守的两个位点,Asp52和Ile232,它们都是处于离酶活性中心8?的位点,然而将其突变为保守氨基酸残基后导致酶的比活力分别下降80%、60%。 4.C.crenatum OTC模拟持续性乙酰化修饰突变对其活性的影响:通过质谱分析发现C.crenatum敲除去乙酰化酶的编码基因cobB后,OTC增加了乙酰化修饰位点Lys294。对质谱显示的乙酰化修饰位点Lys30、Lys281、Lys294进行模拟乙酰化修饰突变,发现以上蛋白突变体酶活性都有不同程度的降低。测定了WT和突变体K294Q对底物L-鸟氨酸的Km分别为0.28mM和0.31mM;相比于WT,K294Q与底物L-鸟氨酸的亲和力有所下降,导致酶活力的降低。

关键词

钝齿棒杆菌/鸟氨酸氨甲酰基转移酶/蛋白表达/酶学性质/氨基酸残基

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授予学位

硕士

学科专业

领域生物学

导师

陈雪岚

学位年度

2022

学位授予单位

江西师范大学

语种

中文

中图分类号

Q93
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