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基于生物信息学分析的肝癌转移相关基因NPNT的发现及功能研究

黄灵坤

基于生物信息学分析的肝癌转移相关基因NPNT的发现及功能研究

黄灵坤1
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作者信息

  • 1. 广西大学
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摘要

肝癌是一种常见的恶性肿瘤,在全球范围内肝癌的发病率和死亡率都位于前列,是癌症相关死亡的第三大原因。据统计,2020年全球有905677例肝癌新增病例和830180例肝癌死亡病例,主要分布在东亚、东南亚、北非和西非地区。在中国,肝癌是癌症死亡的第二大原因。近几十年来,研究表明我国长江中下游等东部地区肝癌的发病率和死亡率明显高于我国中西部地区。由于肝癌的死亡率高,预后差,肝癌成为我国严重的疾病负担。目前对于肝癌的治疗主要是手术治疗、放射治疗、化学药物治疗、免疫治疗和中药治疗。手术治疗虽然是最有效的治疗方法,但大部分肝癌患者在初次确诊时就已经是中晚期,不适合手术治疗,且手术切除后复发率高,肝移植失败率高;放疗和化疗毒副作用大;免疫治疗和靶向治疗是重要的辅助治疗手段,但由于缺乏相应的治疗靶点,其在临床上的应用受到限制,肝癌的治疗仍面临巨大的挑战。肿瘤转移是肝癌死亡的主要原因。因此挖掘肝癌转移相关的潜在靶点,探索肝癌转移的潜在分子机制,对肝癌的治疗及开发新的靶向药物具有重要意义。肾连蛋白(Nephronectin,NPNT)在多种癌症组织中高表达,促进肿瘤的增殖、迁移和侵袭,但其在肝癌转移中的作用机制仍未报道。在本研究中,我们通过加权基因共表达网络分析(WeightedGeneCorrelationNetworkAnalysis,WGCNA)挖掘与肝癌转移相关的基因模块,通过多种生物信息学分析方法筛选,最终确定关键基因NPNT。随后对NPNT在肝癌转移中的作用机制进行初步探讨。研究内容如下: (1)通过WGCNA分析筛选与肝癌转移高度正相关的基因模块。 (2)通过多种生物信息学分析方法(差异基因表达分析、GO/KEGG分析、生存分析、Cox回归分析等)发现NPNT是肝癌转移相关的潜在关键基因;利用表达分析和免疫组化技术确认NPNT在肝癌组织中高表达。 (3)通过siRNA(SmallinterferingRibonucleicAcid)转染、MTT实验、细胞划痕实验、Transwell实验分别检测NPNT对肝癌细胞增殖和侵袭的影响。 (4)通过GSEA(GeneSetEnrichmentAnalysis)分析和Westernblot实验初步探讨NPNT促进肝癌细胞侵袭的作用机制。 研究结论: (1)与癌旁相比,NPNT高表达于肝癌组织;与非转移性肝癌组织相比,NPNT高表达于转移性肝癌组织。 (2)生存分析和单因素多因素Cox分析结果表明NPNT可以作为肝癌不利生存期的独立危险因素。 (3)干扰NPNT的表达能抑制肝癌细胞侵袭及FAK/PI3K/AKT信号通路。

关键词

肝癌/生物信息学/肾连蛋白

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授予学位

硕士

学科专业

生物学

导师

吴黎川

学位年度

2022

学位授予单位

广西大学

语种

中文

中图分类号

R73
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