摘要
背景及目的：甲状腺癌是常见的内分泌系统恶性肿瘤之一。由于诊断影像和疾病监测的普及和发展，甲状腺的发病率持续升高，近年女性甲状腺癌发病率位居世界第五；随着发病率的增加和死亡率的降低，如何平衡治疗方法是一个不可避免的问题。本研究旨在证实miR-222-3p及其靶基因在甲状腺癌患者生存预后和免疫浸润中的作用。 资料与方法：基于GEO和TCGA数据库，评估miR-222-3p在甲状腺癌和正常甲状腺组织中的差异表达；再通过基因差异表达分析获取TCGA数据库的甲状腺癌数据集中的DEGs；利用miRWalk3.0预测了miR-222-3p可能的靶基因；将DEGs和预测得到的可能的靶基因之间重叠的基因鉴定为miR-222-3p的共识基因；对共识基因进行GO注释、KEGG靶向通路富集和GSEA分析；通过PPI网络的模块分析得到关键靶基因。然后，我们利用生物信息学分析探讨了关键靶基因的表达情况，基于UALCAN对关键靶基因进行表达评估，同时对相关临床数据进行分析；通过GEPIA2进行miR-222-3p与关键靶基因相关性分析及关键靶基因的成对相关性分析、生存分析和综合分析；通过HPA数据平台评估关键靶基因的蛋白表达情况；最后通过TIMER和CIBERSORT数据库评估miR-222-3p及其关键靶基因在免疫浸润中的意义。 结果：本研究表明NEGR1、NTNG1、XPNPEP2、NTNG2、CD109、OPCML和PRND是关键基因。miR-222-3p在甲状腺癌中高表达，这可能直接或间接地导致甲状腺癌中NEGR1低表达和PRND高表达。甲状腺癌中NEGR1低表达提示预后良好，PRND高表达提示预后不良。7个关键基因与性别、年龄、种族、肿瘤分期和淋巴结转移显著相关。此外，七基因生物标志物具有一定的诊断价值。NEGR1的表达下调可能通过靶向细胞粘附通路以及P53通路对甲状腺癌的发生、侵袭和转移产生影响。最后，甲状腺癌免疫微环境中的B细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞可能受到CD109的调控。 结论：miR-222-3p在甲状腺癌中高表达可能直接或间接导致NEGR1表达下调进而影响甲状腺癌的预后。CD109的表达与免疫细胞密切相关，尤其是与B细胞和CD4+T细胞明显相关。因此，miR-222-3p及其关键靶基因有望成为甲状腺癌预后的生物标志物，并可能是甲状腺癌免疫浸润的调控因子。
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