摘要
目的： 肾透明细胞癌（clear cell carcinoma of renal，ccRCC）是泌尿系统常见恶性肿瘤之一，我国发病率低于欧美国家但是呈逐年递增趋势，威胁国民尤其是中老年人群的健康及生命安全。由于简便可靠的早期筛查手段缺乏，很大一部分患者临床确诊时已至中晚期甚至无法进行手术治疗，明确对ccRCC发生发展产生重要影响的基因并进行靶向干预是延长此类患者生存时间、优化其生活质量的最主要方法。ccRCC的发病机制尚不明确，病情相似患者经规范化治疗后预后差异较大，可能存在某些对病情及预后产生重要影响的分子，积极寻找明确此类分子对ccRCC的治疗及临床预后具有重要意义。ccRCC的相关基因研究已经开展较多，导致信息整合工作量巨大、难度倍增，这也是目前ccRCC关键基因明确困难、新靶向治疗研究方案确定困难的重要内在原因。GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。随着高通量微阵列杂交技术、测序技术的迅猛发展，以及基因数据的 爆炸式增加，深入挖掘GEO等世界上最大存储高通量分子数据的公共数据库对肿瘤的机制探索等具有重要意义。本研究对挖掘GEO数据库中ccRCC相关关键基因，以期寻找ccRCC发生的关键基因以及可能的治疗新靶点。 方法： 参照标准化流程对GEO数据库中的芯片数据进行收集、处理、整合，使用R语言程度进行分析并以热图、火山图展现，使用蛋白-蛋白相互作用网络图、GO富集、KEGG信号通路分析以判断ccRCC的差异化表达基因。将表达量差异＞2倍且P＜0.05作为差异基因的判断标准。采用Kaplan-Meier生存曲线分析筛选出的差异基因对ccRCC患者生存预后的影响。 结果： 本次检测样本中共存在298个表达差异的基因，其中表达上调的基因有209个、表达下调的基因有89个。绘制热图、火山图后进一步精准选定候选基因，进一步通过GO富集、KEGG通路分析以及STRING在线工具对候选差异基因的通路及编码蛋白进行分析，发现差异蛋白及编码其的基因主要集中在FCGR2B、TYROBP、C3AR1、FCER1G、C1QA、C1QB、LY86、MS4A6A、FCGR3B、CTSS、C1QC、LAPTM5、CD14、HCK、VSIG4、MS4A4A等16个基因上，再对这些关键基因进行文献挖掘发现，FCGR2B基因可能是与ccRCC发生发展相关的关键基因。且发现ccRCC患者中具体FCGR2B基因表达量与其生存预后存在一定关联。 结论： ccRCC的发生发展及转移等过程依赖癌细胞的增殖、转移、凋亡等功能相关基因的表达异常，发现并整理与ccRCC病情、预后密切相关的异常表达基因对于疾病病因的深入研究、新型治疗方案的研发等均十分重要。我们使用GEO数据库进行芯片数据检索、系统分析ccRCC与正常肾脏组织间基因表达的差异，发现FCGR2B基因与ccRCC的发生及预后均关系密切，为后续ccRCC发病机制及治疗方法的深入研究提供新的潜在基因位点。
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