摘要
黑色素瘤是一种高致死率的皮肤肿瘤,它起源于神经嵴的黑色素细胞。目前判断患者预后的依据主要是肿瘤分期和临床病理特征。而根据美国癌症联合委员会(AJCC)黑色素瘤分期系统第8版,仅将乳酸脱氢酶(LDH)水平作为具有重大预后价值的血清学标志物,但LDH具有敏感性和特异性低的缺点。其他血清学标志物如C反应蛋白(CRP)、黑色素瘤抑制活性蛋白(MIA)和程序性死亡配体-1(PD-L1)等局限性较大,也不能作为普适预测指标。肿瘤组织活检以及组织学检测指标如Breslow厚度、溃疡状态、有丝分裂率等,仍是黑色素瘤诊断、治疗、预后的金标准。寻找其他潜在的具有较高预测价值的指标是近年来的热点。细胞自噬是真核细胞中进化保守的细胞内物质转运过程,通过抑制p53肿瘤抑制蛋白的诱导过程、维持线粒体协助癌细胞抵抗微环境压力在各种癌症的病程中具有重要作用。 目的:通过分析细胞自噬相关基因(ARGs)在皮肤黑色素瘤(SKCM)的表达水平及临床价值,寻找潜在的可预测患者预后相关基因。 方法:从癌症基因组图谱下载SKCM患者差异性表达的基因数据,与人类自噬数据库(HADB)中ARGs进行对比,筛选出两个数据集中均存在的基因,并在SKCM数据集GSE46517和GSE15605中进行确认。再使用在线工具如TISCH、HPA和cBioportal完成TNFSF10和SKCM临床特征的相关性分析。最后使用DiseaseMeth2.0、UCSC XENA以及TISIDB在线工具分析TNFSF10基因的表达或甲基化与患者预后、肿瘤免疫浸润水平的相关性。 结果:(1)ARGs在SKCM和正常细胞中的表达水平存在差异;(2)TNFSF10表达水平与患者预后之间存在强相关性;(3)SKCM患者的临床病理特征与其TNFSF10表达水平下降有关;(4)SKCM患者TNFSF10的表达和甲基化与免疫浸润相关。 结论:细胞自噬相关基因TNFSF10是判断患者预后高价值的预后标志物,以及具有作为免疫治疗反应的分子标记物的能力。