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非编码RNA介导铜死亡相关基因SLC31A1高表达与乳腺癌不良预后和肿瘤免疫浸润相关

刘以原

非编码RNA介导铜死亡相关基因SLC31A1高表达与乳腺癌不良预后和肿瘤免疫浸润相关

刘以原1
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作者信息

  • 1. 汕头大学
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摘要

背景: 乳腺癌是当今全世界女性发病率最高的恶性肿瘤,造成了巨大的社会负担。铜死亡是肿瘤领域的研究热点之一。SLC31A1作为铜转运蛋白家族基因的一员,参与铜死亡进程,与肿瘤发生相关。然而,SLC31A1在乳腺癌中的具体作用和机制仍然需要进一步的研究。 目的: 本研究旨在探究铜死亡相关基因SLC31A1在乳腺癌中的作用、相关机制以及分析其在乳腺癌中的预后和肿瘤免疫细胞浸润情况。 方法: 本研究应用TCGA和GTEx数据首次对SLC31A1的表达水平和预后进行泛癌分析。另外,对SLC31A1在乳腺浸润性癌中的表达水平和预后进行验证,并进行了单因素和多因素Cox回归分析。在此基础上,本研究构建了乳腺浸润性癌患者OS的列线图,并绘制校正曲线进行评价。此外,本研究还对SLC31A1的共表达基因进行了GO富集分析、KEGG通路分析以及GSEA分析。同时,通过多种分析(包括表达水平分析、相关性分析以及生存分析)发现了导致SLC31A1过表达的上游非编码RNA通路。此外,本研究还对SLC31A1的表达水平与肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞标志物以及免疫检查点表达水平之间的相关性进行分析。最后,本研究采用来自CellMiner数据库的数据对SLC31A1表达水平和药物敏感性的相关性进行探索。 结果: 本研究阐明了SLC31A1在包括乳腺浸润性癌在内的多种人类癌症中呈高表达水平,并且与乳腺浸润性癌的临床病理特征显著相关,与其不良预后呈正相关。单因素和多因素Cox回归分析结果表明SLC31A1表达水平对乳腺浸润性癌有重要影响并可作为一个独立预后指标。在此基础上构建了一个乳腺浸润性癌患者OS的列线图来整合SLC31A1表达和其他临床危险因素,并绘制了校准曲线对SLC31A1的列线图效能进行评价。GO富集分析以及KEGG通路富集分析的结果表明SLC31A1的共表达基因主要富集在细胞内蛋白运输、细胞内核与胞质间转运等。本研究还对SLC31A1的共表达基因进行了GSEA分析,结果主要富集在PI3K/AKT/mTOR、mTORC1、IL-2/STAT5、KRAS、TNF-α/NF-kB以及IL-6/JAK/STAT3等信号通路上。另外,本研究确定了乳腺浸润性癌中SLC31A1最可能的上游非编码RNA调控机制,即LINC00511/miR-29c-3p/SLC31A1调控轴。此外,乳腺浸润性癌中SLC31A1的表达水平与免疫细胞浸润、免疫细胞生物标志物以及免疫检查点表达水平呈显著正相关。最后,本研究的结果表明SLC31A1的表达水平可能可以作为某类药物敏感性高低的判断标准。 结论: 本研究的结果提示,非编码RNA介导铜死亡相关基因SLC31A1高表达与乳腺癌不良预后和肿瘤免疫浸润相关。

关键词

乳腺癌/铜死亡相关基因/不良预后/免疫浸润

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授予学位

硕士

学科专业

外科学

导师

陈业晞

学位年度

2022

学位授予单位

汕头大学

语种

中文

中图分类号

R73
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