摘要
【目的】 1.检测hsa_circ_0001944在白血病及健康人群中的表达水平。 2.研究hsa_circ_0001944在氢醌恶转细胞中的作用。 3.探讨氢醌诱导的恶性转化细胞中hsa_circ_0001944,PARP1(聚ADP核糖聚合酶1)与HuR(人蛋白R)的关系。 【方法】 1.白血病患者与对照组的选择 广东医科大学湛江附属医院收集30位白血病患者与30位对照组体检人员各5mL新鲜血液。样品收集后立即-80?C储存。按照白血病患者的年龄,性别,吸烟和饮酒史,筛选对照组成员进行配对。 2.细胞的选择 利用氢醌恶转细胞模型模拟白血病的发病过程。分别用氢醌及磷酸盐缓冲液处理TK6细胞20周后得到氢醌恶转细胞模型,并分别为其命名为HQ-TK6细胞与PBS-TK6细胞。 3.基因表达水平的检测 细胞与血液总RNA分别使用TRIzol试剂和HighPureRNAIsolationKit试剂盒进行提取,利用qRT-PCR技术检测CircRNA及有关信使RNA的表达水平。收集5×106个细胞之后使用裂解液裂解细胞提取总蛋白,利用BCA法检测提取的总蛋白浓度,WesternBlotting用于检测有关蛋白的表达水平。 4.hsa_circ_0001944敲低细胞株的构建 采用CRISPR/CAS9基因编辑方法,在课题组前期培养的HQ-TK6细胞基础上,再转染空载体或靶向敲低hsa_circ_0001944的慢病毒,使用嘌呤霉素筛选出转染细胞株,用qRT-PCR对其表达量进行敲除鉴定。 5.流式细胞术检测凋亡、周期及ROS含量 凋亡与周期分别采用AnnexinV-PE/7AAD试剂盒与PI对细胞进行预处理;ROS检测采用DHE探针进行孵育标记。制备样品,处理完成后立刻上机检测其凋亡、周期分布水平及细胞内部ROS含量。 6.生物信息学的分析 在生物信息学网站(http://rbpmap.technion.ac.il/;http://www.rnainter.org/;http://rbpdb.ccbr.utoronto.ca/;http://gepia2.cancer-pku.cn)预测hsa_circ_0001944的靶标RNA结合蛋白以及白血病内的PARP1的表达。 7.统计学分析 实验结果的各项指标通过SPSS软件进行统计学分析。计量资料采用mean±s进行表示,采用t检验及方差分析进行组间比较,检验水准α=0.05。 【结果】 1.CircRNA在白血病人群与HQ-TK6细胞中的表达情况: qRT-PCR检测结果显示,白血病患者体内hsa_circ_0001944的表达水平相对于对照组而言是上升,在HQ-TK6细胞中hsa_circ_0001944的表达相对于PBS-TK6细胞上升,差异有统计学意义(P<0.05)。 2.CircRNA敲低细胞株的构建: 利用HQ-TK6细胞以RNAi构建hsa_circ_0001944敲低细胞株,利用qRT-PCR检测其敲低效率,差异有明显的统计学意义(P<0.05)。为其命名为shNC,sh1944-1,sh1944-2与sh1944-3。由于sh1944-3在培养时发现凋亡率大于其增长效率,导致无法扩增样品无法收集,故弃用。 3.hsa_circ_0001944的敲低导致细胞周期迟滞: 与shNC细胞相比,CCK-8实验中sh1944-1与sh1944-2在72h后其吸光度有下降,差异具有明显的统计学意义。利用流式细胞术检测hsa_circ_0001944敲低对周期的影响。相对于shNC组,sh1944-1呈现出G1/S期停滞现象,G1期细胞数量上升10.1%,S期细胞数量下降10.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。 4.hsa_circ_0001944的敲低诱导细胞凋亡: 流式细胞术显示,相对于shNC细胞,sh1944-1的凋亡率有显著上升,其差异有统计学意义(P<0.05)。共聚焦成像证实,相对于shNC细胞,sh1944-1及sh1944-2的LC3A/B蛋白分布均有所差异,与细胞核有重叠,证实hsa_circ_0001944的敲低诱导细胞发生自噬从而引发凋亡。 5.WesternBlotting检测相关通路蛋白表达: 检测shNC,sh1944-1及sh1944-2细胞内凋亡、周期及DNA损伤相关蛋白的表达。与对照组相比,Bcl2,Bax,LC3A/B,Ki67,P-Rb,PARP1与H-Ras均呈下降趋势,γ-H2AX的表达量上升,HuR表达量不变。综合以上WB结果可推测,hsa_circ_0001944可参与凋亡通路、细胞周期以及DNA损伤修复通路的调节。 6.生物信息学预测hsa_circ_0001944的靶标RNA结合蛋白: 生物信息学分析不同数据库预测hsa_circ_0001944的靶标RNA结合蛋白,取交集后发现唯一的一个靶标RNA结合蛋白为HuR,提示两者间存在相互作用。 7.hsa_circ_0001944解离HuR与PARP1的结合: 生物信息学提示白血病患者中PARP1的表达与对照组相比要低,与hsa_circ_0001944敲低后PARP1的表达相符。共聚焦成像可看出,HuR、PARP1与hsa_circ_0001944都在胞质中互相重叠,提示有结合的可能。结合HuR的表达在hsa_circ_0001944敲低前后并无改变,我们推测,hsa_circ_0001944解离HuR与PARP1的结合并影响PARP1的表达。 【结论】 1.hsa_circ_0001944在白血病患者以及氢醌恶转TK6细胞中均表达上升。 2.在氢醌恶转TK6细胞中hsa_circ_0001944和PARP1通过自噬和细胞周期机制调节细胞生长。 3.hsa_circ_0001944解离HuR与PARP1的结合并影响PARP1的表达。