摘要
背景： 结直肠癌（CRC）是消化系统中最常见的恶性肿瘤之一，其发病机制多样而复杂，转移率和死亡率高，迫切需要寻找新的生物标志物来治疗并改善患者的预后。N6-甲基腺苷（m6A）修饰在癌症中以多种机制发挥着关键作用，lncRNA作为调节因子影响基因的表观遗传，对癌症的发生和进展产生了重要的影响。 目的： 本研究旨在通过对公共数据库中结直肠癌的基因表达数据和临床资料进行生物信息学分析，以探究m6A相关lncRNA对结直肠癌的预后、发病机制和免疫浸润的影响，为结直肠癌的治疗提供新的生物标志物。 方法： 结合癌症基因组图谱（TCGA）数据库和m6A2target数据库筛选出m6A相关lncRNAs，采用了内部分组验证的方式，进行单因素、Lasso、多因素Cox回归分析鉴定了结直肠癌预后相关lncRNAs，根据风险评分建立模型并对预后进行预测。通过对差异基因的基因本体论（GO）及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析探究其潜在机制，并使用CIBERSORT算法和基因集富集分析（GSEA）探究了高低风险组之间的免疫浸润差异。最后，使用肿瘤免疫功能障碍和排斥（TIDE）评分比较高低风险组对免疫检查点抑制剂（ICIs）的敏感性。 结果： 从TCGA数据库和m6A2target数据库共筛选了904个m6A相关lncRNAs。通过单因素、Lasso和多因素Cox回归分析进一步鉴定了7个m6A相关lncRNAs，包括LINC00638、PCAT6、UBA6-AS1、AC00904.13、AC090517.2、VIM-AS1、FGD5-AS1。高风险组的预后显著差于低风险组，风险评分可作为独立的预后因素。此外，差异表达基因的GO富集分析揭示了高低风险组均在受体或酶的活性上富集，低风险组还在免疫应答及信号传递的正向调节中富集。KEGG富集分析显示了低风险组主要富集于代谢相关通路，高风险组主要富集于癌症相关通路。低风险组表现出对免疫检查点抑制剂更好的敏感性。 结论： m6A相关的7个lncRNAs（LINC00638、PCAT6、UBA6-AS1、AC00904.13、AC090517.2、VIM-AS1、FGD5-AS1）可作为结直肠癌预后的生物标志物，构建的预后风险模型可预测结直肠癌的预后情况。本研究为结直肠癌的预后提供了新的生物标志物，并有利于进一步分析结直肠癌发生和进展的机制。
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