摘要
目的：年龄相关性黄斑变性(AMD)是一种病因不明的多因素的发达国家老年人中最主要的致盲疾病。氧化应激（OS）反应与年龄相关性黄斑变性的病理进展有关。然而,关于OS相关基因的生物标志物在AMD中的潜在诊断价值知之甚少，而且其在AMD免疫微环境的相关性尚未被研究。因此本研究通过一系列生物信息学分析构建OS基因相关诊断模型，并研究OS基因相关亚型在调节AMD免疫微环境的相关性。 方法：通过健康对照与AMD的黄斑区视网膜和视网膜色素上皮-脉络膜复合体样本进行的差异分析，获得表达异常的OS基因。通过单因素logistic回归、LASSO和SVM筛选特征基因。利用多因素logistic构建OS基因诊断模型。研究了非晚期和晚期AMD的分型与浸润免疫细胞、免疫反应基因集、HLAs（人白细胞抗原）、补体基因基因等免疫微环境特征的相关性。而后在AMD样本中系统地评估由鉴定出由OS关键基因介导亚型与免疫微环境特征的关系。然后对通过差异表达分析获得的与OS介导的亚型相关的基因进行go和kegg富集分析以显示它们的生物学功能。 结果：在健康与AMD样本对比的差异分析中得到13个显著的氧化应激基因，表明它们富集于免疫相关通路。从PPI网络中鉴别6个hub基因。通过筛选获得5个关键基因，而后构建得到曲线下面积ROC为0.875的良好诊断模型。非晚期和晚期AMD的浸润免疫细胞丰度、免疫反应活性没有明显差别，而在HLAs（人白细胞抗原）、补体基因基因中部分存在差异。在AMD样本中系统地评估由鉴定出由5个关键基因介导的2种亚型中，亚型1存在更高水平的免疫细胞丰度，而亚型2有更高水平的免疫反应活性，而两者大部分补体基因表达水平基本一致。鉴定出351亚型相关基因和48个免疫相关基因，对其还进行了功能和基因本体（GO）分析，以揭示富含这些基因的潜在途径。通过WGCNA分析得到亚型-1正相关的模块hub基因。 结论：本研究发现了有助于AMD诊断的5个氧化应激关键生物物标志物，构建了具有良好预测效果的诊断模型。获得与氧化应激关键基因介导亚型相关的hub基因，同时揭示了AMD免疫微环境中潜在的氧化应激相关调控机制。
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