摘要
长江上游的水能资源十分充沛，同时其生物多样性也十分丰富。近些年，梯级工程的建设将大江截流，破坏了河流的天然连续性，对生态环境以及生物资源多样性造成了很大的影响。生活在长江中上游的小型底栖杂食性鱼类对生境有着较高的依赖性，其分布较广，在各种地貌中形成了不同的生态群体，非常适合当作研究遗传多样性的实验材料。本研究根据中华纹胸鮡（Glyptothoraxsinense）与中华金沙鳅（Jinshaiasinensis）的分布特点，于2017年在长江中上游的格里坪、合江、黑水河、牛栏江、巧家、宜宾等地区分别取样232、224尾，对其展开遗传多样性研究，从而进一步分析水电站的建设对其生活的影响，制定相应的政策，在发展清洁能源的同时保证生物资源不被破坏。本研究的主要研究结果如下： 在NCBI的Genome数据库中找到中华纹胸鮡与中华金沙鳅的线粒体DNA全序列，与PCR产物测序结果比对，确定两种鱼的控制区（D-loop）起止位点。中华纹胸鮡的D-loop区长度为876-880bp，长度变异较小，中华金沙鳅则在888-918bp之间，长度变异略大于中华纹胸鮡。8个群体的中华纹胸鮡共有135个变异位点，中华金沙鳅则有219个，识别出了两种鱼D-loop区的保守序列。对整个控制区以及其中的三个保守区段的碱基特征进行了分析。找到了ETAS的核心序列ACTA、核心序列的反向互补序列TGTA和CSB-1的特征序列GACATA。 计算了各群体两种鱼的遗传多样性参数并进行了遗传距离的了分析。几乎全部地区的中华金沙鳅群体与半数地区的中华纹胸鮡群体表现为丰富的单倍型多样性（Hdgt;0.5），还有丰富的核苷酸多样性（Pigt;0.005）。中华金沙鳅的平均Hd与Pi分别为0.94114和0.01869，中华纹胸鮡为0.75675和0.00596。在遗传多样性方面，各地区的中华金沙鳅表现比较相近，并且其总体来看要高于中华纹胸鮡。 鉴别分析了两种鱼的单倍型，制作了单倍型网络图与单倍型进化树，并对其进行了AMOVA分析。中华纹胸鮡的单倍型网络图分支明显，地区特有单倍型聚群，且以优势单倍型为中心呈星状分布；中华金沙鳅则没有明显的分支趋势，地区特有单倍型分散，优势单倍型很少。这说明中华纹胸鮡各地区的遗传分化比较明显，中华金沙鳅则不明显。单倍型进化树与AMOVA分析都侧面印证了这一结论。在AMOVA分析中，中华纹胸鮡的分子变异主要来自于不同地区的群体间，占比61.26%。这表明中华纹胸鮡不同地区存在着较大的群体分化；中华金沙鳅则正好相反，仅占4.047%。物种内的分子变异占总体变异的主要部分。 对两种鱼进行了中性检验，绘制了核酸错配分布曲线。中华纹胸鮡的宜宾、绥江大汶溪群体的Tajima’sD和Fu’s值为显著的负数，分别为-1.91068、-11.67323和-1.65616、-12.58743。但核酸错配分布曲线只有黑水河、牛栏江与合江群体呈单峰趋势，说明这些群体在过去有一定可能出现过快速扩张或持续增长。中华金沙鳅各群体的中性检验无显著负值，核酸错配曲线也并未呈单峰，说明其发生快速扩张或持续增长的概率非常小。
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