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大豆根区微生物组的动态特征及对施肥的响应规律研究

Peter Semba Mosongo

大豆根区微生物组的动态特征及对施肥的响应规律研究

Peter Semba Mosongo1
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作者信息

  • 1. 中国科学院大学
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摘要

植物生长在土壤中,土壤含有大量微生物和营养物质,是影响植物健康和生长的两个主要因素。在正常情况下,土壤微生物组没有单一的物种占绝对主导地位。植物需要特定的微生物在其根际生长,以提供营养以及保护植物免受病原菌侵害。另一方面,土壤养分在自然界中是有限的,农作物的需求在自然条件下很少完全得到满足。通常需要通过施肥向土壤中添加营养物质,以满足植物正常生长和产量优化的需要。研究表明,向土壤中添加肥料会改变土壤中的自然微生物平衡,可能减少有益微生物的丰度。大豆是最重要和广泛栽培的豆科植物之一。几个世纪以来,这种作物一直被认为是人类的蛋白质来源,还被用作动物饲料。在工业上,它已被用作生物燃料、食用油以及生产机油等应用。在农学上,大豆是一种重要的豆科植物,因为它参与生物固氮。这种植物与共生固氮细菌形成共生关系,将大气中的氮固定成硝酸盐,供植物利用。研究表明,豆科植物对这些细菌的选择具有高度的特异性。这种关系是物种水平上特有的,目前这种选择机制仍需要深入的研究,以找到能够提高生物固氮速率的高效菌株。在田间条件下对根瘤菌的研究很少。本研究的主要目的是了解氮肥如何影响大豆招募微生物组的机制。具体研究目标如下: 1.探讨不同施肥方案对大豆根系微生物组和作物产量的影响。 2.评价田间条件下同一大豆品种在不同生长季选择性富集的根瘤菌的特征以及对施肥的响应。 3.利用华北平原常见的8个品种研究品种对根瘤菌富集的影响。 4.揭示大豆根区代谢物响应根瘤菌菌株和氮素输入的机制。 5.鉴定大豆根系分泌物对常见土壤真菌病原体的抗菌特性。 针对上述体目标,我们设计了一个田间实验,采用两种施肥方案:化学施肥(U)和有机肥(M),每种施肥量为27kg-N/ha。将两种处理与未添加肥料的对照(C)进行比较。我们假设大豆将特定细菌吸引到其根际以执行特定功能。在此基础上,我们选择了根际中丰度最高的属,并研究了它们在生长阶段V3、R3、R5和R7的相对丰度如何变化。我们还检查了这些属在其他根际、土壤以及三种处理中的丰度。为了评估根瘤菌的田间富集和补充,我们调查了对照土壤和在上述四个生长阶段在田间种植大豆的根际土壤中的根瘤菌丰度。我们使用盆栽试验评估了不同大豆品种对根瘤菌的偏好并利用水培实验研究根区代谢物响应根瘤菌菌株和氮素输入的机制。水培实验中使用两组营养物质:富含氮(CN)的和缺氮(CK)的Hoagland溶液来培养大豆幼苗。两组各有一个对照和接种不同根瘤菌菌株的三个处理:S.xinjaingensis(S1)、B.japonicum(S2)和,S.fredii(S3)。培养后收集每个重复的根段用于代谢物分析。对大豆根系分泌物进行了针对真菌病原体的测试,利用马铃薯葡萄糖琼脂培养基(PDA)测试了根系分泌物对镰刀菌属的三个菌株F.oxysporum(Fp),F.graminearum(Fg),和F.Proliferatum(Fp)的影响。 统计分析表明,对照土壤和根区不同部位的微生物群落结构存在显着差异。在田间条件下生长的大豆植物在根际建立了一个独特的微生物组,其中包含很多已经报道的有益的微生物。施肥处理减少了这些潜在有益微生物的富集。在四个生长阶段中,根际细菌的相对丰度在化肥处理中较有机肥和对照土壤低。施加化肥和有机肥都实现了作物产量的增加。与对照(C)相比,施肥(U和M)处理中的大豆干重在统计学上更高。这些结果表明,虽然在两种施肥方案中都能实现产量,但有机肥保留了土壤中潜在的植物促生菌的自然丰度。因此,连续使用化肥可能会减少土壤微生物资源,而有机肥能够保持较高的微生物丰度和多样性。在田间实验揭示了随着大豆生长根瘤菌逐渐在根瘤中富集,在R5阶段达到峰值。不同施肥方案对根瘤菌富集的影响也表现出不同,化肥(U)的根瘤菌丰度最低,有机肥肥次之,对照组最高。在盆栽实验中,使用相同类型土壤种植了八个大豆品种,发现在其根瘤中招募的不同根瘤菌属丰度存在种间差异。大豆品种JD-19显示出独特的根瘤菌富集特征,富集了几乎相同丰度的Ensifer和Bradyrhizobium。同一土壤类型生长的不同大豆品种对不同根瘤菌属的富集表明根瘤菌的选择性富集是基于品种而不是土壤因素。前人研究曾提出假说,认为土壤类型和土壤pH值决定了普遍存在的根瘤菌,其中Ensifer在碱性土壤中普遍存在,而Bradyrhizobium在酸性土壤中普遍存在。这一结果为开发新的根瘤菌产品提供了大豆品种及其所偏好根瘤菌的新知识。水培实验发现氮素输入增加了根系代谢物中的有机酸和氨基酸含量。三种根瘤菌菌株接种也导致了根系代谢物组成的差异,类黄酮和部分有机酸表现出根瘤菌菌株物种特异性。与CK相比,CN处理中与富集根际微生物组和控制植物病原体的代谢物相关的代谢物降低。在CN处理中,接种S3与接种另外两个菌株相比在根系代谢物中检测到了更高水平的类黄酮类物质。这些结果表明,氮水平是影响土壤中根瘤菌富集的因素之一,菌株S3适合开发高氮环境中使用的固氮菌剂。同时发现大豆根系分泌物对所使用的三种镰刀菌具有抗真菌特性,表明除了具有根瘤菌富集具功能,还具有协助协助植物抗病功能。

关键词

大豆/根瘤菌/根区微生物组/代谢物/施肥

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授予学位

博士

学科专业

生态学(微生物生态学)

导师

胡春胜;刘彬彬

学位年度

2022

学位授予单位

中国科学院大学

语种

中文

中图分类号

S5
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