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GJD2、LAMA1基因-环境交互作用与广西中学生近视发生的关联研究

刘玥

GJD2、LAMA1基因-环境交互作用与广西中学生近视发生的关联研究

刘玥1
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作者信息

  • 1. 广西医科大学
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摘要

目的: 本研究分析影响近视发生的环境因素以及GJD2、LAMA1基因多态性与近视的关系,探讨GJD2、LAMA1基因-环境交互作用对广西汉、壮族中学生近视发生发展的影响,为近视的防控及发病机制提供科学依据。 方法: 以贵港市和南宁市武鸣区中学生为研究对象,以班级为单位进行整群抽样。采用频数匹配的病例-对照研究方法,按照性别、民族、年龄(±1)、BMI(±2)进行匹配,共纳入446例患近视的学生和446例视力正常的学生。对全体研究对象进行问卷调查(内容包括电子产品的使用情况、作业时间等近视的环境影响因素)、体格检查和视力检测,同时采集外周静脉血3ml,用于DNA提取。使用Mass ARRAY核酸质谱分析系统对GJD2基因rs3743123位点、LAMA1基因rs2089760、rs8090011位点进行基因型检测。运用PLINK1.07软件分别对三个基因位点进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验、等位基因、基因型频率的分布分析及五种遗传模型分析;利用SHE sis在线平台进行LD(linkage disequilibrium,连锁不平衡)及单体型分析;运用SPSS25.0对问卷和体检资料进行t检验、?2检验及Logistic回归分析;基于叉生分析的原理,结合Logistic回归分析构建基因-基因、基因-环境交互作用的相加和相乘模型。 结果: (1)研究对象基本信息:本次研究共纳入446例患近视的学生及446例对照,经均衡性检验发现性别、民族在病例组和对照组的分布一致,两组均为男生291名(65.2%)、女生155名(34.8%),汉族203人、壮族243人。病例组年龄为(14.19±1.27)岁,BMI为(19.14±2.60)kg/m2,对照组年龄为(14.21±1.27)岁,BMI为(19.22±2.66)kg/m2,年龄及BMI在两组间差异均无统计学意义(P>0.05)。 (2)近视的环境影响因素分析:经单因素分析进行近视危险因素的变量筛选后(检验水准a<0.1),通过多因素分析结果显示(检验水准a<0.05)以下五项:有喜爱吃甜食的饮食习惯(OR=1.37,95%CI=1.002~1.874,P=0.048),出生时发生难产(OR=3.821,95%CI=1.000~14.598,P=0.049),学习时坐姿不端正(OR=1.832,95%CI=1.311~2.560,P=0.001),在家学习时灯光照明过暗(OR=2.234,95%CI=1.107~4.508,P=0.025),本学期每天做作业的时间大于1小时(OR=1.612,95%CI=1.015~2.559,P=0.043)为近视发生的环境危险因素。 (3)基因多态性与近视的关联性分析:GJD2rs3743123及LAMA1rs2089760、rs8090011均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05),其中GJD2rs3743123的等位基因及基因型频率在病例组和对照组中的分布差异均有统计学意义(P<0.05)。校正是否有喜爱甜食的饮食习惯、出生时分娩情况、学习时坐姿情况、在家学习时灯光照明情况、以及本学期做作业的时间后,GJD2rs3743123在等位基因遗传模型中,A等位基因相较G等位基因对近视具有保护作用(OR=0.712,95%CI=0.546~0.930,P=0.013),在显性遗传模型中携带(GA+AA)基因型的个体发生近视的风险是携带GG基因型个体的0.646倍(OR=0.646,95%CI=0.476~0.877,P=0.005)。LAMA1基因位点rs2089760、rs8090011的等位基因及基因型频率在病例组和对照组中分布差异均无统计学意义(P>0.05),校正近视的环境危险因素后,rs2089760、rs8090011位点在五种遗传模型分析中均未发现与近视的发生存在相关性(P>0.05)。 (4)对LAMA1基因两个位点进行连锁不平衡及单体型分析,结果显示D?=0.127,r2=0.003,rs2089760与rs8090011两个位点间不存在连锁不平衡;四种单体型与近视的发生无关联(P>0.05)。 (5)基因-基因交互分析:校正民族、BMI及近视的环境危险因素后,结果显示GJD2基因rs3743123位点分别与LAMA1基因rs2089760、rs8090011位点存在基于相加模型的基因-基因交互作用,同时携带rs3743123位点GG基因型和rs2089760位点TT基因型或同时携带rs3743123位点GG基因型和rs8090011位点GG基因型均会使近视的患病风险显著增加(P<0.05)。相乘模型结果仅显示LAMA1rs2089760与GJD2rs3743123之间存在基因之间的交互作用。 (6)分层分析:按民族进行分层分析,各SNP位点对近视的影响效应在汉、壮族间不存在差异,一致性检验结果显示差异均无统计学意义(P>0.05)。 (7)基因-环境交互分析:GJD2rs3743123与出生时分娩情况、学习时坐姿情况、在家学习时灯光照明情况、本学期每天做作业时间、以及是否有喜爱甜食的饮食习惯均存在交互作用(P<0.05),其中携带GG基因型的个体分别暴露于出生时发生难产、学习时坐姿不端正、在家学习时灯光照明过暗、本学期每天做作业的时间大于1小时,有喜爱甜食的饮食习惯较单独暴露于上述环境危险因素其患近视的风险均增加(P<0.05);结合相加模型和相乘模型结果提示LAMA1rs2089760分别与出生时发生难产、在家学习时灯光照明过暗、本学期每天做作业的时间大于1小时存在交互作用;LAMA1rs8090011与在家学习时灯光照明过暗、每天做作业的时间大于1小时存在交互作用,均与近视易感性相关(P<0.05)。 结论: (1)出生时发生难产、学习时坐姿不端正、在家学习时灯光照明过暗、本学期每天做作业的时间大于1小时,有喜爱甜食的饮食习惯是近视发生的环境危险因素。 (2)携带GJD2rs3743123GG基因型的个体与携带GA/AA基因型的个体相比,发生近视的风险将增加。 (3)GJD2rs3743123与LAMA1rs2089760的交互作用与近视易感性相关。 (4)GJD2rs3743123及LAMA1rs2089760、rs8090011对近视的影响效应在汉、壮族间不存在差异。 (5)携带GJD2rs3743123GG基因型的个体分别暴露于出生时发生难产、学习时坐姿不端正、在家学习时灯光照明过暗、本学期每天做作业的时间大于1小时、有喜爱甜食的饮食习惯的环境危险因素,均会使近视患病风险显著增加;在LAMA1rs2089760、rs8090011与环境的交互作用分析中显示,近视的发生是环境危险因素起主要影响效应。

关键词

近视/发病机制/GJD2基因/LAMA1基因/环境因子

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授予学位

硕士

学科专业

儿少卫生与妇幼保健学

导师

李春灵

学位年度

2021

学位授予单位

广西医科大学

语种

中文

中图分类号

R77
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