摘要
目的: 阿霉素(Doxorubicin,DOX)的临床应用因其心脏毒性而受到限制。许多研究表明微RNA(MicroRNA,miRNA)在DOX诱导的心脏毒性中至关重要。本研究旨在探讨let-7i-3p在DOX诱导的心脏毒性中的作用及其潜在机制。 方法: 使用适当浓度的DOX对人源性AC16心肌细胞进行处理,以处理前的AC16细胞作为对照组,通过RNA测序(RNA sequencing, RNA-seq)技术分析鉴定差异表达基因(Differentially expressed genes ,DEGs);通过基因本体(Gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对DEGs进行富集分析;使用STRING在线数据库结合Cytoscape软件分析蛋白互作关系(protein-protein interactions,PPI)并绘制出可视化网络图;通过定量实时聚合酶链反应( quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证差异基因并筛选出差异最显著的基因用于后续研究。使用筛选出的miRNA模拟物(mimic)和抑制物(inhibitor)转染AC16细胞,设置转染后DOX处理组,通过检测细胞活力、细胞中活性氧(reactive oxygen species,ROS)的产生情况、丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量和超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性,以及细胞凋亡和自噬,评估miRNA对DOX处理的AC16细胞的细胞活力、氧化应激以及细胞凋亡和自噬的影响。使用生物信息学预测软件结合RNA-seq结果筛选let-7i-3p 的靶基因,使用 qRT-PCR 测定靶基因表达水平并进行let-7i-3p与靶基因的相关性分析。采用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)转染技术验证靶基因在DOX诱导的心脏毒性中的作用。通过qRT-PCR和蛋白质印迹( Western blot )实验进一步验证miRNA对靶基因的调控作用。通过Western blot实验测定哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信号通路上关键蛋白质的表达水平,明确let-7i-3p/mTOR信号通路在DOX诱导的自噬失调中的作用。采用t检验和单因素方差分析进行统计学分析,数据以平均值±标准误(SEM)表示,以P<0.05为差异有统计学意义。 结果: 1. RNA-seq结果显示,在使用DOX处理后的AC16细胞中,共发现24个差异表达的miRNA ( Differentially expressed miRNA , DE miRNA )和1619个差异表达的mRNA ( Differentially expressed mRNA,DE mRNA),其中20个miRNA表达上调,4个miRNA表达下调;进一步通过qRT-PCR对差异显著的前6个miRNA分子进行验证,结果显示,与对照组相比,DOX显著上调了AC16细胞中let-7i-3p的表达(P<0.05),上述结果与测序结果一致; 2.使用let-7i-3p mimic和inhibitor转染AC16细胞,成功实现了AC16细胞中let-7i-3p的表达上调和下调。与未转染组和转染阴性对照组相比,在DOX处理后及上调let-7i-3p表达的AC16细胞活力降低,细胞中ROS水平和MDA含量升高,而SOD活性下降,细胞凋亡和自噬增加(P<0.05)。下调let-7i-3p表达的AC16细胞活力增加,细胞中ROS水平和MDA含量下降,而SOD活性升高,细胞凋亡和自噬减少(P<0.05); 3.通过生物信息学软件结合RNA-seq结果我们初步预测核糖体蛋白S6激酶2(ribosomal protein S6 kinase 2,RPS6KA2)是let-7i-3p的靶基因。qRT-PCR和Western blot实验结果显示,上调let-7i-3p的表达之后,RPS6KA2的mRNA表达和蛋白水平发生明显下调,而下调let-7i-3p的表达后,RPS6KA2的蛋白水平发生明显上调。此外,相关性分析结果显示,let-7i-3p与RPS6KA2呈显著负相关(r=-0.80,p<0.01); 4.通过 Western blot 实验我们发现 let-7i-3p 不仅可以负性调控RPS6KA2在AC16细胞中的表达,还可通过下调RPS6KA2蛋白表达进而抑制mTOR信号通路,从而介导了DOX诱导下AC16细胞的自噬增加。 结论: 1. let-7i-3p在DOX处理前后的AC16心肌细胞中具有明显表达差异; 2. let-7i-3p降低了DOX处理条件下的AC16细胞活力,促进了AC16细胞中的氧化应激、凋亡和自噬; 3. let-7i-3p通过负性调控RPS6KA2加重了DOX诱导的心脏毒性,这部分是通过促进心肌细胞中的氧化应激、凋亡以及mTOR信号通路介导的自噬而实现的。