摘要
雷琼黄牛是我国南方热带地区的良种肉牛，具有良好的耐湿热、耐粗饲和抗逆性，但生长速度慢、体格小和肉色较浅，探索其杂交改良技术对提高养殖效益和新品种育成有重要意义。试验选取了2岁龄健康雷琼黄牛公牛与利雷杂交一代公牛(利木赞♂×雷琼黄牛♀)各3头，2至5岁雷琼黄牛母牛与利雷杂交一代母牛各3头，屠宰取12至13肋骨间背最长肌进行肉品质评价；测定100头2岁龄雷琼黄牛背最长肌CIE色差值，选取深色与浅色极端性状各4头(每组公牛与母牛各2头)进行转录组学测序，筛选肉色性状相关基因；分析肉色相关基因的多态性，与肉色性状进行关联分析，寻找可用于遗传育种辅助选择的分子标记。 研究发现: (1)利雷杂交一代和雷琼黄牛肌肉pH1h均大于6.0,pH24h均小于6.5，品种间无显著差异(p＞0.05)。2岁龄雷琼黄母牛的滴水损失、2-4岁龄蒸煮损失及2-5岁龄压力失水率均显著高于同龄利雷杂交一代母牛(p＜0.05)。利雷杂交一代公牛肌肉亮度、红度和黄度均显著高于雷琼黄牛公牛(p＜0.05)。与雷琼黄牛母牛相比，2岁龄利雷杂一代母牛宰后1h肌肉亮度、红度和黄度，3-4岁龄亮度和黄度均显著增高(p＜0.05)；2-3岁龄利雷杂交一代母牛宰后24h肌肉亮度和黄度均显著高于雷琼黄牛母牛(p＜0.05)。利雷杂交一代牛肌肉剪切力明显低于同年龄同性别的雷琼黄牛，且随年龄增长而变大。利雷杂交一代牛眼肌面积均显著高于同年龄同性别的雷琼黄牛(p＜0.05)。 (2)转录组结果共鉴定出13233个DEGs,其中上调328个，下调162个；差异基因涉及一般功能预测、翻译后修饰、蛋白质折叠和伴侣蛋白、细胞过程、单生物代谢过程、生物调节、肌动蛋白细胞骨架的调节及细胞凋亡等，大部分基因存在于细胞、细胞部分、细胞器和膜中。GSTP1、HSPA2和LDHD基因在深色与浅色肌肉组间显著差异表达(p＜0.05)。 (3)GSTP1基因的g.45441933G＞C、g.45444249A＞G、g.45444424G＞A、g.45444613G＞A、g.45441935G＞A、g.45441998C＞T、g.45442471C＞G、g.45444484A＞C；HSPA2基因的g.76680461G＞A；LDHD基因的g.2453066T＞G、g.2453710T＞C、g.2453823T＞C、g.2453892T＞C、g.2454359G＞C、g.2454360A＞G、g.2454411A＞C、g.2454425C＞T、g.2454603G＞T、g.2456394C＞T、g.2456478T＞G和g.2456704G＞A位点与雷琼黄牛肉色性状存在显著相关(p＜0.05)。 结论: (1)与雷琼黄牛相比，利雷杂交一代牛眼肌面积增大，肉色鲜艳，肌肉嫩度增加，系水力增大。利用利木赞杂交雷琼黄牛能显著提高肌肉品质，是雷琼黄牛杂交改良的有效手段。 (2)雷琼黄牛极端性状深色和浅色肌肉差异基因上调328个，下调162个。一般功能预测，翻译后修饰、蛋白质折叠和伴侣蛋白，细胞过程，单生物代谢过程，生物调节，肌动蛋白细胞骨架的调节及细胞凋亡等多个生物功能参与雷琼黄牛浅色肌肉性状的形成和调控。 (3)GSTP1、HSPA2和LDHD基因是影响雷琼黄牛肉色性状的候选基因。GSTP1基因存在7个多态性位点，HSPA2基因存在1个多态性位点，LDHD基因存在12个多态性位点对雷琼黄牛肉色性状有显著影响，可作为改善雷琼黄牛肉色性状的潜在的分子标记。
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