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多功能Acr IF24抑制I-F型CRISPR-Cas系统的分子机制研究
多功能Acr IF24抑制I-F型CRISPR-Cas系统的分子机制研究
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NETL
中文摘要:
CRISPR-Cas是一种原核生物的噬菌体防御系统,反过来,噬菌体也利用相应的anti-CRISPR蛋白(Acrs)来对抗CRISPR-Cas系统。本文研究一种anti-CRISPR蛋白AcrIF24,解析了 AcrIF24及其与crRNA引导的监视复合物(Csycomplex)(Csy-AcrIF24)的结构,同时,通过一系列生化实验,阐明了AcrIF24抑制I-F型CRISPR-Cas系统的分子机制。本文发现AcrIF24中HTH基序能结合到Acr启动子区域,并抑制其转录,揭示了它们作为Aca基因对Acr表达的调控作用。另一方面AcrIF24本身也是同源二聚体,并能进一步引发Csy复合物发生二聚化,形成Csy-AcrIF24异源四聚体。Csy-AcrIF24及Csy-dsDNAsp结构对比及生化实验发现,AcrIF24对酶切活性的抑制作用主要有两个途径:一方面AcrIF24和靶标DNA能竞争性地结合Csy复合物,即AcrIF24阻断靶标DNA与crRNA的结合;另一方面,AcrIF24具有与AcrIF9相似的诱导序列非特异性dsDNA与Csy复合物结合的作用。进一步分析Csy-AcrIF24-dsDNA复合物结构及生化机制表明,AcrIF24的HTH基序以及Csy复合物中PAM识别环是Csy-AcrIF24结合序列非特异性dsDNA的必要结构元件。引起AcrIF24对非特异性结合DNA结合能力下降的突变体,其对CRISPR-Cas系统的抑制作用也下降。总之,本论文系统阐释了AcrIF24多重功能作用机制,为I-F型系统调控工具的开发奠定基础。
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作者:
丁浩
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关键词:
噬菌体
CRISPR-Cas系统
AcrIF24蛋白
抑制机制
授予学位:
硕士
学科专业:
生物与医药
导师:
冯越;陈发荣
学位年度:
2023
学位授予单位:
北京化工大学
语种:
中文
中图分类号:
Q7