摘要
肾透明细胞癌(Kidneyrenalclearcellcarcinoma,KIRC)是一种致命的泌尿系统癌症，是肾细胞癌中最常见的亚型。近年来，KIRC的患病率呈现逐步上升的趋势，虽然随着医疗水平的不断发展，肿瘤临床检出率也在逐步提高，但是由于KIRC有一定的隐匿性，其死亡率仍然处在较高水平。许多研究表明，非编码RNA和DNA甲基化在肿瘤发生发展过程中有重要的调控作用。因此，可以从非编码RNA和DNA甲基化两个方面探究KIRC的发病机制，并寻找其预后生物标志物，为KIRC的靶向治疗提供一定的理论支持。 首先，从TCGA数据库中下载KIRC的mRNA、lncRNA和miRNA的表达数据，DNA甲基化数据以及临床数据。基于差异表达基因和临床特征构建加权基因共表达网络，寻找与疾病状态相关性最强的yellow模块，并对yellow模块中的202个基因构建蛋白质相互作用网络寻找hub基因，选择连接度排名前10的基因，并对这10个基因进行Kaplan-Meier生存分析，生存曲线显示，其中8个基因在KIRC患者中生存率有显著差异，并且这8个基因高表达组患者的总生存率都低于低表达组，对这8个基因进行GO和KEGG分析，发现主要参与细胞分裂和细胞周期等通路。 其次，基于DEmRNA、DEmiRNA和DElncRNA构建ceRNA网络，并且对网络中的RNA进行单因素和多因素Cox回归分析并构建预后模型，建立了由4个mRNA组成的预后模型。将KIRC患者分为高、低风险组，生存曲线表明两组患者的生存率存在明显差异（P＜0.001）,ROC曲线下面积为0.754,表明该模型具有一定的预测价值。为了确认风险评分是否可以作为独立的预后指标，使用单因素和多因素Cox回归对临床特征M分期、N分期、T分期、肿瘤阶段、年龄和风险评分进行分析，结果表明肿瘤阶段、年龄和风险评分都是影响KIRC预后的独立因素，并且ROC曲线表明风险评分作为预测KIRC预后的独立因素,预测能力较强。然后构建列线图来定量预测，有助于寻找新的治疗靶点，为临床提供了一定的理论指导。 最后，为了探究DNA甲基化对KIRC的影响，计算在1stExon、3''UTR、5''UTR、Body、TSS200和TSS1500区域中DNA甲基化与基因表达的相关性，并将相关性较强的基因与原癌基因和抑癌基因取交集后进行生存分析，结果显示，在一些区域内，低甲基化促进原癌基因的表达，高甲基化抑制抑癌基因的表达，从而共同导致KIRC的发生。
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