摘要
由Erysiphequercicola引起的橡胶树白粉病是全世界橡胶种植区重要的病害之一，由于缺乏具有多态性的分子标记，与橡胶树白粉菌群体遗传相关的研究较少，全基因组序列为开发SSR标记提供可能。本研究基于橡胶树白粉菌的全基因组序列，筛选出16个具有多态性的SSR标记，利用开发出的SSR标记对来自云南、海南、粤西和粤东等主要植胶区白粉病菌样进行基因分型，旨在了解我国E.quercicola的群体遗传结构。16个SSR标记基因型多样性较高，等位基因数为4到14不等，基因多样性为0.240到0.787不等。在387个E.quercicola菌样中，总共观察到309个多位点基因型，大部分菌样有特有的多位点基因型，地区间存在共享基因型。云南群体与海南、粤西和粤东群体相比，基因型多样性指数、基因型均匀度、Nei基因多样性、等位基因丰富度和私有等位基因丰富度都较高。STRUCTURE分析和DAPC分析表明，海南、粤东和粤西群体大部分菌样聚为一类，以云南群体为主的菌样单独聚为一类。成对遗传分化表明云南群体与其他群体有明显的差异，海南、粤西和粤东三个群体之间的遗传分化很小。海南、粤西和粤东地区基因交流频繁。分子方差变异分析表明，地区间变异占总遗传变异性22.4%。遗传距离与地理距离显著正相关（Rxy=0.772，P=0.001）。连锁平衡分析表明部分群体可能发生了遗传重组。对种群历史动态进行分析表明，云南群体与其他地区群体存在共同祖先，在演变过程中发生分化。结果表明，云南群体和其他群体之间存在显著的遗传差异，但海南、粤西和粤东三个地区群体遗传差异较小。
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